110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0137 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1193    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4062  hypothetical protein  37.33 
 
 		 359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  40.74 
 
 		 309 aa  141  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  35 
 
 		 328 aa  138  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2876  plasmid-related protein  32.23 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0061217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4199  hypothetical protein  36.36 
 
 		 339 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  34.76 
 
 		 334 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  32.62 
 
 		 336 aa  117  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  36.08 
 
 		 371 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1766  putative DNA primase, DNA transfer TraO- like protein  48.08 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0683835  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0460  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  45.19 
 
 		 524 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.919355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2645  putative DNA primase, DNA transfer TraO- like protein  40.91 
 
 		 495 aa  97.4  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1853  hypothetical protein  32.44 
 
 		 220 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.053538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0174  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  43.93 
 
 		 529 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85378  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4271  hypothetical protein  34.7 
 
 		 344 aa  95.1  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6277  phage P4 alpha zinc-binding protein  35.88 
 
 		 355 aa  94.4  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  32 
 
 		 321 aa  94  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5218  Phage P4 alpha, zinc-binding  32.42 
 
 		 355 aa  92.8  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6493  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  43.27 
 
 		 507 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.255427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.22 
 
 		 355 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6336  hypothetical protein  43.16 
 
 		 559 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  27.78 
 
 		 296 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1551  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.49 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5216  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.49 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  27.16 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5356  hypothetical protein  34.84 
 
 		 297 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7521  hypothetical protein  40 
 
 		 522 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952259  normal  0.397074 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  25.74 
 
 		 348 aa  76.6  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5824  hypothetical protein  27.08 
 
 		 402 aa  76.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  30.5 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  26.75 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  30.56 
 
 		 341 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6543  hypothetical protein  28.81 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  26.13 
 
 		 344 aa  72  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  37.31 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  25.11 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  28.8 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  25.62 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  26.13 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5209  virulence-associated protein E  33.76 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  29.63 
 
 		 320 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  25.98 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  28.96 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  27.95 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  25.6 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1111 aa  64.3  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  28.33 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5573  hypothetical protein  25.31 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  25.63 
 
 		 342 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  26.5 
 
 		 343 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  25.39 
 
 		 348 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  25.62 
 
 		 344 aa  63.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  25.62 
 
 		 344 aa  63.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  25.73 
 
 		 344 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  27.65 
 
 		 345 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  26.37 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  28.33 
 
 		 351 aa  62.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  28.07 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  24.62 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2785  hypothetical protein  27.22 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4768  hypothetical protein  34.51 
 
 		 996 aa  61.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439128  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4553  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.51 
 
 		 994 aa  60.8  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  24.63 
 
 		 345 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  22.03 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  32.48 
 
 		 866 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  25.91 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  25.87 
 
 		 1557 aa  58.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  26.11 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  25.56 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3438  virulence-associated protein E  26.85 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  25.56 
 
 		 346 aa  57  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  26.92 
 
 		 1557 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  30.39 
 
 		 1389 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  23.6 
 
 		 353 aa  55.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  23.33 
 
 		 348 aa  54.7  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  33.67 
 
 		 1536 aa  54.7  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  23.94 
 
 		 352 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7414  hypothetical protein  30.36 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  24.57 
 
 		 283 aa  52.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  32.26 
 
 		 1538 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  31.47 
 
 		 895 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  35.79 
 
 		 878 aa  51.6  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  22.55 
 
 		 346 aa  50.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  34.44 
 
 		 929 aa  50.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  36.96 
 
 		 776 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  31.78 
 
 		 890 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  31.78 
 
 		 890 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  31.43 
 
 		 847 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3240  DNA primase  34.83 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  31.91 
 
 		 763 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  33.93 
 
 		 763 aa  49.7  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0246  hypothetical protein  30.28 
 
 		 388 aa  48.5  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  33.93 
 
 		 273 aa  48.5  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  25.68 
 
 		 665 aa  47.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  40.26 
 
 		 777 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8283  hypothetical protein  24.04 
 
 		 357 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  32.74 
 
 		 681 aa  47.4  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.25 
 
 		 1356 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1915  hypothetical protein  28.74 
 
 		 914 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>