51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4768 on replicon NC_009670
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6382  hypothetical protein  60.53 
 
 		 830 aa  714    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4553  relaxase/mobilization nuclease family protein  91.37 
 
 		 994 aa  1800    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4768  hypothetical protein  100 
 
 		 996 aa  2035    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439128  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9808  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  56.04 
 
 		 920 aa  689    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4166  hypothetical protein  49.59 
 
 		 895 aa  560  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0246  hypothetical protein  34.3 
 
 		 388 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4527  hypothetical protein  29.73 
 
 		 745 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.820483  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4269  hypothetical protein  29.47 
 
 		 776 aa  134  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.516015  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4367  hypothetical protein  29.62 
 
 		 456 aa  109  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7521  hypothetical protein  29.26 
 
 		 522 aa  95.9  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952259  normal  0.397074 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6336  hypothetical protein  26.98 
 
 		 559 aa  92.4  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6229  hypothetical protein  25.95 
 
 		 668 aa  89.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.422278 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6493  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  29.77 
 
 		 507 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.255427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4999  hypothetical protein  33.61 
 
 		 321 aa  86.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0460  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  26.48 
 
 		 524 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.919355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5824  hypothetical protein  26.82 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1766  putative DNA primase, DNA transfer TraO- like protein  27.91 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0683835  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0174  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  26.67 
 
 		 529 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85378  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  37.04 
 
 		 1356 aa  79  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2645  putative DNA primase, DNA transfer TraO- like protein  28.18 
 
 		 495 aa  77  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5018  hypothetical protein  35.05 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  37.04 
 
 		 1538 aa  69.3  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6491  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  32.69 
 
 		 337 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.440209  normal  0.634473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  38.1 
 
 		 1536 aa  67.4  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  38.53 
 
 		 1557 aa  67.4  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2643  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2- like  26.42 
 
 		 337 aa  67  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  43.12 
 
 		 1111 aa  65.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6340  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  29.02 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.271931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2834  hypothetical protein  34.78 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.705285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  30.53 
 
 		 575 aa  62  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  37.38 
 
 		 1534 aa  61.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0462  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like  33.02 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1768  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like  28.57 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.546869 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5017  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.57 
 
 		 377 aa  56.6  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0989  MobA/MobL protein  29.12 
 
 		 430 aa  55.1  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0785  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  24.87 
 
 		 321 aa  53.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00514005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0860  hypothetical protein  28.57 
 
 		 371 aa  53.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1675  hypothetical protein  27.91 
 
 		 380 aa  52.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.25502 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4188  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  30.19 
 
 		 351 aa  51.6  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3327  plasmid-related protein  30.19 
 
 		 351 aa  51.6  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4839  plasmid-related protein  30.19 
 
 		 351 aa  51.6  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.658809  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3325  hypothetical protein  26.49 
 
 		 340 aa  51.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4841  hypothetical protein  26.49 
 
 		 340 aa  51.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4190  hypothetical protein  26.49 
 
 		 336 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0760  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  27.22 
 
 		 344 aa  48.9  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0308  plasmid-related protein  30.56 
 
 		 344 aa  48.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0791  plasmid-related protein  30.56 
 
 		 344 aa  48.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435871  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0017  hypothetical protein  30.82 
 
 		 344 aa  48.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.125294 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0176  Relaxase/mobilization nuclease family protein  34.91 
 
 		 349 aa  45.8  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0486311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4526  hypothetical protein  24.58 
 
 		 368 aa  45.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5826  hypothetical protein  24.44 
 
 		 363 aa  44.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>