30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2645 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1766  putative DNA primase, DNA transfer TraO- like protein  71.84 
 
 		 506 aa  663    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0683835  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2645  putative DNA primase, DNA transfer TraO- like protein  100 
 
 		 495 aa  983    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6493  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  60 
 
 		 507 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.255427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0174  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  53.71 
 
 		 529 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85378  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0460  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  52.26 
 
 		 524 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.919355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4841  hypothetical protein  57.96 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3325  hypothetical protein  57.96 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4190  hypothetical protein  56.69 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6336  hypothetical protein  30.9 
 
 		 559 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5824  hypothetical protein  32.28 
 
 		 402 aa  117  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7521  hypothetical protein  31.99 
 
 		 522 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952259  normal  0.397074 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  41.94 
 
 		 575 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0860  hypothetical protein  43.3 
 
 		 371 aa  87.4  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4768  hypothetical protein  28.18 
 
 		 996 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439128  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5018  hypothetical protein  37.29 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1675  hypothetical protein  38.95 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.25502 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0246  hypothetical protein  25.69 
 
 		 388 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4553  relaxase/mobilization nuclease family protein  26.74 
 
 		 994 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4999  hypothetical protein  38.17 
 
 		 321 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  33.33 
 
 		 1389 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  33.33 
 
 		 1557 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  36.04 
 
 		 1111 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2834  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  53.5  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.705285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0989  MobA/MobL protein  33.77 
 
 		 430 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  34.74 
 
 		 1557 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4367  hypothetical protein  34.33 
 
 		 456 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0106  relaxase/Mobilization nuclease domain protein  28.68 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392069  normal  0.357718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  35.79 
 
 		 1536 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  32.99 
 
 		 1538 aa  44.3  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.58 
 
 		 1534 aa  43.9  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>