20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0860 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0860  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  743    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1675  hypothetical protein  59.31 
 
 		 380 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.25502 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0460  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  42.11 
 
 		 524 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.919355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0174  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  37.27 
 
 		 529 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85378  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2645  putative DNA primase, DNA transfer TraO- like protein  43.3 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1766  putative DNA primase, DNA transfer TraO- like protein  44.33 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0683835  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6493  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  44.79 
 
 		 507 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.255427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6336  hypothetical protein  38.04 
 
 		 559 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5018  hypothetical protein  37.78 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4999  hypothetical protein  36.21 
 
 		 321 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0246  hypothetical protein  46.48 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4367  hypothetical protein  42.31 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3325  hypothetical protein  34.45 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4841  hypothetical protein  34.45 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5824  hypothetical protein  35.29 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4190  hypothetical protein  37.8 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7521  hypothetical protein  34.83 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952259  normal  0.397074 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4768  hypothetical protein  28.57 
 
 		 996 aa  53.1  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439128  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4553  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.57 
 
 		 994 aa  52.8  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2834  hypothetical protein  25.4 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.705285  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>