20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4190 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4841  hypothetical protein  98.81 
 
 		 340 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3325  hypothetical protein  98.81 
 
 		 340 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4190  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  676    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2645  putative DNA primase, DNA transfer TraO- like protein  56.08 
 
 		 495 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0460  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  45.59 
 
 		 524 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.919355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1766  putative DNA primase, DNA transfer TraO- like protein  53.79 
 
 		 506 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0683835  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0174  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  45.74 
 
 		 529 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85378  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6493  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  54.36 
 
 		 507 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.255427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5018  hypothetical protein  41.24 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4999  hypothetical protein  29.75 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7521  hypothetical protein  29.84 
 
 		 522 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952259  normal  0.397074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0860  hypothetical protein  37.8 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1675  hypothetical protein  34.94 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.25502 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5824  hypothetical protein  29.67 
 
 		 402 aa  52.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0246  hypothetical protein  28.93 
 
 		 388 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0989  MobA/MobL protein  31.58 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6336  hypothetical protein  28.72 
 
 		 559 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4768  hypothetical protein  26.49 
 
 		 996 aa  49.3  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439128  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4553  relaxase/mobilization nuclease family protein  32.86 
 
 		 994 aa  46.2  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4367  hypothetical protein  32.84 
 
 		 456 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>