34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0174 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0460  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  71.27 
 
 		 524 aa  653    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.919355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0174  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  100 
 
 		 529 aa  1055    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85378  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6493  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  51.21 
 
 		 507 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.255427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2645  putative DNA primase, DNA transfer TraO- like protein  53.9 
 
 		 495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1766  putative DNA primase, DNA transfer TraO- like protein  51.97 
 
 		 506 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0683835  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4841  hypothetical protein  42.68 
 
 		 340 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3325  hypothetical protein  42.68 
 
 		 340 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4190  hypothetical protein  45.77 
 
 		 336 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6336  hypothetical protein  32.27 
 
 		 559 aa  131  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7521  hypothetical protein  31.8 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952259  normal  0.397074 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5824  hypothetical protein  28.66 
 
 		 402 aa  106  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  43.93 
 
 		 575 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5018  hypothetical protein  37.74 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0860  hypothetical protein  37.27 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4768  hypothetical protein  26.67 
 
 		 996 aa  80.9  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439128  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4999  hypothetical protein  37.01 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4553  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.5 
 
 		 994 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1675  hypothetical protein  35.79 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.25502 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4367  hypothetical protein  24.65 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  26.72 
 
 		 1389 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  26.83 
 
 		 1557 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  40.54 
 
 		 1536 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  33.08 
 
 		 1356 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0246  hypothetical protein  33.67 
 
 		 388 aa  57  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2834  hypothetical protein  30.28 
 
 		 441 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.705285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  43.62 
 
 		 1557 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  39.78 
 
 		 1534 aa  54.3  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a001  nickase/relaxase  27.5 
 
 		 438 aa  53.1  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0555425  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0989  MobA/MobL protein  31.58 
 
 		 430 aa  52.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0106  relaxase/Mobilization nuclease domain protein  29.81 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392069  normal  0.357718 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  36.26 
 
 		 1538 aa  50.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0150  Cpp17  25.96 
 
 		 416 aa  46.2  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000847879  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0012  cpp17  22.33 
 
 		 462 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000347998  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1111 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>