25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2834 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2834  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  893    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.705285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0989  MobA/MobL protein  35.87 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4768  hypothetical protein  34.41 
 
 		 996 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439128  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4553  relaxase/mobilization nuclease family protein  34.41 
 
 		 994 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0460  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  30.61 
 
 		 524 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.919355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0174  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  30.28 
 
 		 529 aa  57  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85378  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2918  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  40 
 
 		 404 aa  57  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1610  Relaxase/mobilization nuclease family protein  41.38 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2898  relaxase/mobilization nuclease domain protein  44.23 
 
 		 413 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000982832 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1709  Relaxase/mobilization nuclease family protein  35.29 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0832  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.27 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5018  hypothetical protein  28.8 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6336  hypothetical protein  31.62 
 
 		 559 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1766  putative DNA primase, DNA transfer TraO- like protein  30.84 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0683835  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4999  hypothetical protein  25.2 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7521  hypothetical protein  29.9 
 
 		 522 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952259  normal  0.397074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6493  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  35.48 
 
 		 507 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.255427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5824  hypothetical protein  28.09 
 
 		 402 aa  47.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2645  putative DNA primase, DNA transfer TraO- like protein  34.92 
 
 		 495 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2897  relaxase/mobilization nuclease family protein  43.9 
 
 		 402 aa  47  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0597444  normal  0.476634 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2943  Relaxase/mobilization nuclease family protein  36.36 
 
 		 386 aa  47  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4367  hypothetical protein  37.31 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1675  hypothetical protein  24.22 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.25502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0860  hypothetical protein  25.4 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0246  hypothetical protein  28.57 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>