36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_pTet0012 on replicon NC_008790
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008790  CJJ81176_pTet0012  cpp17  100 
 
 		 462 aa  948    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000347998  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a001  nickase/relaxase  61.77 
 
 		 438 aa  570  1e-161  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0555425  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0150  Cpp17  43.44 
 
 		 416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000847879  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0106  relaxase/Mobilization nuclease domain protein  33.45 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392069  normal  0.357718 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5017  relaxase/mobilization nuclease family protein  35.75 
 
 		 377 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0031  nickase  29.15 
 
 		 409 aa  107  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.743382  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6340  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  33.16 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.271931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4839  plasmid-related protein  32.95 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.658809  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3327  plasmid-related protein  32.95 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0785  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  31.07 
 
 		 321 aa  99.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00514005 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4934  relaxase/mobilization nuclease family protein  29.59 
 
 		 368 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421912  normal  0.821482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4188  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  32.39 
 
 		 351 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0462  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like  30.14 
 
 		 349 aa  97.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2643  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2- like  32.22 
 
 		 337 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1768  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like  31.87 
 
 		 337 aa  93.2  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.546869 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4977  hypothetical protein  31.46 
 
 		 377 aa  93.2  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6491  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  32.58 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.440209  normal  0.634473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0176  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.43 
 
 		 349 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0486311 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0791  plasmid-related protein  32.22 
 
 		 344 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0308  plasmid-related protein  32.22 
 
 		 344 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0760  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  32.22 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0017  hypothetical protein  27.85 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.125294 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4359  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.32 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.738974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2249  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25.28 
 
 		 368 aa  69.7  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4526  hypothetical protein  25.56 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5826  hypothetical protein  25.84 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6336  hypothetical protein  30.41 
 
 		 559 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0174  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  22.99 
 
 		 529 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85378  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6493  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  28.04 
 
 		 507 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.255427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  26.17 
 
 		 662 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8212  type IV secretion system T-DNA border endonuclease VirD2  25.17 
 
 		 403 aa  44.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0049  hypothetical protein  30.23 
 
 		 523 aa  44.7  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000616443  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  23.53 
 
 		 683 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  22.43 
 
 		 657 aa  43.5  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  24.07 
 
 		 658 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  24.65 
 
 		 657 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>