73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3726 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  91.02 
 
 		 700 aa  1144    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  87.07 
 
 		 665 aa  1089    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  83.41 
 
 		 657 aa  1108    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  93.53 
 
 		 786 aa  1182    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  92.77 
 
 		 793 aa  1193    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  87.48 
 
 		 667 aa  1134    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  93.17 
 
 		 657 aa  1168    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  84.74 
 
 		 662 aa  1089    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  69.63 
 
 		 653 aa  910    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  88.43 
 
 		 660 aa  1114    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  91.49 
 
 		 658 aa  1175    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  91.82 
 
 		 701 aa  1137    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  91.81 
 
 		 678 aa  1176    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  100 
 
 		 657 aa  1307    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  89.39 
 
 		 661 aa  1158    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  90.59 
 
 		 703 aa  1132    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  92.45 
 
 		 661 aa  1162    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  58.37 
 
 		 654 aa  752    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  88.65 
 
 		 683 aa  1126    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  90.51 
 
 		 655 aa  1164    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  51.14 
 
 		 570 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  42.97 
 
 		 661 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  46.01 
 
 		 683 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  42.82 
 
 		 683 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  42.57 
 
 		 707 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  44.35 
 
 		 662 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  42.82 
 
 		 694 aa  438  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  42.58 
 
 		 579 aa  428  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  41.74 
 
 		 583 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  41.24 
 
 		 603 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  41.63 
 
 		 583 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  40.36 
 
 		 579 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  40.09 
 
 		 579 aa  402  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  40.21 
 
 		 625 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  41.02 
 
 		 585 aa  399  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  40.93 
 
 		 578 aa  398  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  41.57 
 
 		 703 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  39.15 
 
 		 579 aa  395  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  40.48 
 
 		 587 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  39.15 
 
 		 579 aa  395  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  39.22 
 
 		 579 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  40.27 
 
 		 587 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  40.3 
 
 		 579 aa  378  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  38.65 
 
 		 603 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  38.09 
 
 		 579 aa  353  4e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  37.78 
 
 		 597 aa  337  5.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  44.47 
 
 		 579 aa  323  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  36.19 
 
 		 573 aa  320  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  46.31 
 
 		 587 aa  319  7.999999999999999e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  45.06 
 
 		 579 aa  313  6.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  45.72 
 
 		 579 aa  312  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  41.94 
 
 		 575 aa  310  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  44.26 
 
 		 583 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  44.78 
 
 		 581 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  37.85 
 
 		 584 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  45.84 
 
 		 579 aa  306  8.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  42.08 
 
 		 579 aa  299  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  43.04 
 
 		 584 aa  274  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  42.18 
 
 		 584 aa  273  7e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  35.13 
 
 		 640 aa  272  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  31.83 
 
 		 642 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  35.99 
 
 		 643 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0854  hypothetical protein  53.67 
 
 		 262 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  45.25 
 
 		 294 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1643  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  31.22 
 
 		 493 aa  159  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1621  hypothetical protein  31.6 
 
 		 516 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0242  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  32.42 
 
 		 526 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.703018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  50 
 
 		 218 aa  154  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1320  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  31.6 
 
 		 516 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.010689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3718  VirD2 components relaxase  91.43 
 
 		 70 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  74.6 
 
 		 83 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3388  hypothetical protein  35.71 
 
 		 123 aa  47.4  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783489 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4856  hypothetical protein  35.29 
 
 		 97 aa  44.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274271  normal  0.0158859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>