66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0855 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  437  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  69.86 
 
 
579 aa  317  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  68.49 
 
 
579 aa  315  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  68.49 
 
 
579 aa  313  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  67.12 
 
 
579 aa  313  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  67.12 
 
 
579 aa  313  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  68.49 
 
 
625 aa  311  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  68.49 
 
 
579 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  66.67 
 
 
579 aa  305  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  66.51 
 
 
579 aa  301  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  65.3 
 
 
579 aa  299  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  65.75 
 
 
585 aa  295  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  69.41 
 
 
579 aa  293  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  64.71 
 
 
587 aa  292  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  66.67 
 
 
578 aa  289  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  63.39 
 
 
584 aa  288  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  64.22 
 
 
603 aa  286  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  61.75 
 
 
579 aa  277  7e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  59.26 
 
 
583 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  61.75 
 
 
579 aa  275  6e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  54.63 
 
 
583 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  58.06 
 
 
575 aa  255  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  55.05 
 
 
584 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  55.96 
 
 
583 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  55.05 
 
 
584 aa  251  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  54.59 
 
 
581 aa  245  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  53.21 
 
 
579 aa  235  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  54.5 
 
 
587 aa  229  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  49.32 
 
 
603 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  51.8 
 
 
587 aa  218  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  54.39 
 
 
597 aa  215  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  50.23 
 
 
573 aa  211  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  46.6 
 
 
654 aa  164  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  49.4 
 
 
653 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  42.72 
 
 
683 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  49.1 
 
 
700 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  50 
 
 
657 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  48.8 
 
 
661 aa  148  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  47.93 
 
 
678 aa  148  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  47.83 
 
 
703 aa  148  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  45.65 
 
 
786 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  48.8 
 
 
793 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  48.19 
 
 
661 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  48.8 
 
 
658 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  44.68 
 
 
657 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  43.85 
 
 
701 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  46.43 
 
 
667 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  44.57 
 
 
683 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  43.39 
 
 
657 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  46.39 
 
 
665 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  47.65 
 
 
660 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  45.51 
 
 
655 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  42.7 
 
 
683 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  42.13 
 
 
707 aa  135  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  40.53 
 
 
661 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  42.33 
 
 
662 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  36.9 
 
 
294 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  44.51 
 
 
694 aa  124  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  37.72 
 
 
662 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4856  hypothetical protein  63.51 
 
 
97 aa  101  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274271  normal  0.0158859 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  33.89 
 
 
703 aa  90.9  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  38.3 
 
 
570 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  48.15 
 
 
83 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  28.57 
 
 
643 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  26.32 
 
 
642 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  32.2 
 
 
640 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>