73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1989 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  91.92 
 
 		 683 aa  1173    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  87.71 
 
 		 678 aa  1116    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  87.26 
 
 		 793 aa  1135    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  87.48 
 
 		 657 aa  1101    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  87.18 
 
 		 661 aa  1100    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  85.8 
 
 		 703 aa  1083    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  90.73 
 
 		 665 aa  1126    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  86.72 
 
 		 657 aa  1095    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  68.17 
 
 		 653 aa  900    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  86.11 
 
 		 662 aa  1114    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  83.06 
 
 		 657 aa  1105    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  87.18 
 
 		 786 aa  1112    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  85.24 
 
 		 655 aa  1097    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  100 
 
 		 667 aa  1322    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  58.21 
 
 		 654 aa  753    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  89.06 
 
 		 661 aa  1153    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  88.16 
 
 		 658 aa  1134    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  86.81 
 
 		 700 aa  1084    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  85.98 
 
 		 701 aa  1077    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  83.82 
 
 		 660 aa  1054    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  50.26 
 
 		 570 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  42.69 
 
 		 661 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  46.81 
 
 		 683 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  45.49 
 
 		 662 aa  455  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  42.88 
 
 		 707 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  43.07 
 
 		 683 aa  458  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  41.28 
 
 		 694 aa  432  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  40.75 
 
 		 583 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  42.6 
 
 		 703 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  39.73 
 
 		 603 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  45.28 
 
 		 579 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  36.95 
 
 		 597 aa  333  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  42.01 
 
 		 583 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  41.79 
 
 		 578 aa  327  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  46.07 
 
 		 579 aa  326  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  46.23 
 
 		 587 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  43.55 
 
 		 579 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  45.54 
 
 		 583 aa  319  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  44.73 
 
 		 579 aa  318  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  41.12 
 
 		 575 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  44.91 
 
 		 579 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  44.15 
 
 		 579 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  46.36 
 
 		 579 aa  313  6.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  46.36 
 
 		 579 aa  313  6.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  45.75 
 
 		 581 aa  313  9e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  42.42 
 
 		 587 aa  312  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  44.88 
 
 		 585 aa  310  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  41.52 
 
 		 625 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  45.89 
 
 		 587 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  44.07 
 
 		 603 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  45.19 
 
 		 579 aa  306  6e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  45.04 
 
 		 579 aa  303  9e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  42.49 
 
 		 579 aa  299  9e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  42.08 
 
 		 579 aa  296  8e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  40.79 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  42.15 
 
 		 573 aa  293  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  42.15 
 
 		 584 aa  294  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  42.28 
 
 		 584 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  42.53 
 
 		 584 aa  276  8e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  35.73 
 
 		 643 aa  264  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  34.63 
 
 		 640 aa  259  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  30.57 
 
 		 642 aa  257  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0854  hypothetical protein  51.07 
 
 		 262 aa  239  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  46.36 
 
 		 294 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1643  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  33.05 
 
 		 493 aa  163  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0242  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  32.8 
 
 		 526 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.703018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1621  hypothetical protein  30.66 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1320  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  30.6 
 
 		 516 aa  154  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.010689 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  46.43 
 
 		 218 aa  141  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3718  VirD2 components relaxase  87.14 
 
 		 70 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  74.6 
 
 		 83 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3388  hypothetical protein  36.73 
 
 		 123 aa  46.6  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783489 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0806  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1115 aa  44.7  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.885506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>