70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0632 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  100 
 
 
643 aa  1306    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  63.45 
 
 
642 aa  855    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  44.41 
 
 
640 aa  499  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  35.06 
 
 
661 aa  298  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  34.54 
 
 
662 aa  289  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  34.95 
 
 
657 aa  286  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  32.82 
 
 
654 aa  286  7e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  35.36 
 
 
793 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  34.58 
 
 
655 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  35.53 
 
 
786 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  34.4 
 
 
667 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  34.89 
 
 
683 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  35.99 
 
 
658 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  33.86 
 
 
661 aa  282  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  35.53 
 
 
703 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  34.09 
 
 
657 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  35.36 
 
 
657 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  35.38 
 
 
707 aa  279  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  35.07 
 
 
660 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  35.18 
 
 
701 aa  276  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  34.72 
 
 
653 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  34.49 
 
 
678 aa  275  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  34.66 
 
 
700 aa  272  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  33.28 
 
 
661 aa  270  7e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  35.37 
 
 
683 aa  267  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  33.79 
 
 
662 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  33.62 
 
 
665 aa  259  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  35.15 
 
 
683 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  33.83 
 
 
570 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  33.01 
 
 
694 aa  244  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  33.11 
 
 
703 aa  231  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  33.53 
 
 
579 aa  225  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  38.86 
 
 
603 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  36.31 
 
 
581 aa  213  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  36.67 
 
 
573 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  40.83 
 
 
587 aa  203  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  36.01 
 
 
578 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  38.41 
 
 
575 aa  200  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  37.54 
 
 
587 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  36.21 
 
 
579 aa  196  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  38.28 
 
 
579 aa  195  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  34.2 
 
 
584 aa  194  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  36.1 
 
 
579 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  36.59 
 
 
579 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  38.32 
 
 
583 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  38.54 
 
 
579 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  36.8 
 
 
587 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  37.14 
 
 
579 aa  191  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  36.89 
 
 
585 aa  190  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  38.17 
 
 
579 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  37.25 
 
 
625 aa  189  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  34.95 
 
 
583 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  36.34 
 
 
579 aa  187  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  34.53 
 
 
579 aa  187  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  33.81 
 
 
584 aa  186  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  38.85 
 
 
583 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  36.09 
 
 
584 aa  186  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  37.74 
 
 
597 aa  181  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  35.96 
 
 
579 aa  180  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  39.17 
 
 
603 aa  179  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  34.83 
 
 
579 aa  175  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  34.83 
 
 
579 aa  175  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0854  hypothetical protein  45.1 
 
 
262 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1643  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  30.29 
 
 
493 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0242  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  30.91 
 
 
526 aa  127  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.703018  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1320  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  29.69 
 
 
516 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.010689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1621  hypothetical protein  29.6 
 
 
516 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  32.37 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  27.43 
 
 
218 aa  54.7  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0806  hypothetical protein  25.86 
 
 
1115 aa  45.4  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.885506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>