73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1293 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  90.74 
 
 		 786 aa  1149    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  100 
 
 		 657 aa  1311    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  93.17 
 
 		 657 aa  1163    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  88.99 
 
 		 655 aa  1141    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  89.83 
 
 		 678 aa  1142    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  90.2 
 
 		 793 aa  1153    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  87.75 
 
 		 661 aa  1129    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  68.76 
 
 		 653 aa  894    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  84.28 
 
 		 662 aa  1090    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  86.47 
 
 		 665 aa  1073    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  83.54 
 
 		 657 aa  1105    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  86.72 
 
 		 667 aa  1122    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  86.86 
 
 		 660 aa  1089    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  88.6 
 
 		 703 aa  1108    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  88.06 
 
 		 683 aa  1111    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  58.07 
 
 		 654 aa  743    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  89.97 
 
 		 661 aa  1127    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  90.6 
 
 		 701 aa  1129    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  88.85 
 
 		 700 aa  1109    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  88.89 
 
 		 658 aa  1137    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  51.92 
 
 		 570 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  42.46 
 
 		 661 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  45.3 
 
 		 683 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  42.69 
 
 		 683 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  44.39 
 
 		 662 aa  445  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  41.1 
 
 		 707 aa  435  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  42.32 
 
 		 694 aa  430  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  40.77 
 
 		 703 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  38.97 
 
 		 587 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  46.79 
 
 		 579 aa  332  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  37.09 
 
 		 573 aa  332  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  36.52 
 
 		 597 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  42.35 
 
 		 578 aa  321  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  45.59 
 
 		 587 aa  319  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  37.59 
 
 		 579 aa  318  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  43.23 
 
 		 579 aa  316  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  42.26 
 
 		 575 aa  313  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  43.6 
 
 		 603 aa  313  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  41.56 
 
 		 583 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  41.63 
 
 		 579 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  41.47 
 
 		 579 aa  310  6.999999999999999e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  44.55 
 
 		 579 aa  310  8e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  43.79 
 
 		 583 aa  309  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  43.59 
 
 		 587 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  42.51 
 
 		 625 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  43.97 
 
 		 579 aa  305  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  45.14 
 
 		 581 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  45.21 
 
 		 585 aa  303  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  42.89 
 
 		 579 aa  303  8.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  42.89 
 
 		 579 aa  303  8.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  42.15 
 
 		 603 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  44.47 
 
 		 583 aa  302  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  42.55 
 
 		 579 aa  300  5e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  44.77 
 
 		 579 aa  299  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  43.24 
 
 		 579 aa  297  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  36.56 
 
 		 584 aa  293  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  42.07 
 
 		 579 aa  288  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  43.8 
 
 		 584 aa  277  5e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  35.44 
 
 		 643 aa  271  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  31.02 
 
 		 642 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  43.53 
 
 		 584 aa  270  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  34.7 
 
 		 640 aa  269  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0854  hypothetical protein  53.21 
 
 		 262 aa  239  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  42.99 
 
 		 294 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1643  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  31.09 
 
 		 493 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0242  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  33.42 
 
 		 526 aa  161  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.703018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1621  hypothetical protein  32.27 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1320  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  32.43 
 
 		 516 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.010689 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  44.5 
 
 		 218 aa  144  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3718  VirD2 components relaxase  88.57 
 
 		 70 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  75.93 
 
 		 83 aa  87.4  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4856  hypothetical protein  39.29 
 
 		 97 aa  44.3  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274271  normal  0.0158859 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0012  cpp17  22.43 
 
 		 462 aa  43.9  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000347998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>