66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0039 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  72.43 
 
 		 683 aa  352  5e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  72.57 
 
 		 707 aa  346  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  64.23 
 
 		 683 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  48.46 
 
 		 703 aa  202  6e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  41.35 
 
 		 654 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  46.36 
 
 		 667 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  41.67 
 
 		 653 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  44.34 
 
 		 661 aa  172  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  44.44 
 
 		 661 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  43.44 
 
 		 793 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  43.38 
 
 		 657 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  42.73 
 
 		 694 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  45.25 
 
 		 786 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  43.44 
 
 		 657 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  43.44 
 
 		 658 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  44.59 
 
 		 660 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  45.05 
 
 		 700 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  42.79 
 
 		 678 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  41.36 
 
 		 683 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  43.18 
 
 		 665 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  42.47 
 
 		 661 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  42.86 
 
 		 662 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  41.44 
 
 		 655 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  41.18 
 
 		 657 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  42.73 
 
 		 703 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  42.73 
 
 		 701 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  41.47 
 
 		 662 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  43.68 
 
 		 579 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  43.75 
 
 		 579 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  43.1 
 
 		 579 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  40.51 
 
 		 579 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  40.51 
 
 		 579 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  41.03 
 
 		 625 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  40.11 
 
 		 583 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  38.5 
 
 		 579 aa  132  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  44.79 
 
 		 587 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  41.18 
 
 		 583 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  43.5 
 
 		 603 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  46.43 
 
 		 597 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  43.71 
 
 		 575 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  41.67 
 
 		 603 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  36.9 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  36.36 
 
 		 579 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  44.05 
 
 		 584 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  42.94 
 
 		 587 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  37.95 
 
 		 579 aa  125  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  38.86 
 
 		 579 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  41.67 
 
 		 584 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  38.38 
 
 		 579 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  44.64 
 
 		 584 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  40.48 
 
 		 583 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  37.44 
 
 		 579 aa  122  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  37.97 
 
 		 585 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  39.41 
 
 		 579 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  39.04 
 
 		 579 aa  115  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  41.72 
 
 		 573 aa  115  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  38.5 
 
 		 581 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  39.04 
 
 		 578 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  37.89 
 
 		 587 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  42.86 
 
 		 570 aa  92.8  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3388  hypothetical protein  43.41 
 
 		 123 aa  87  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783489 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  27.8 
 
 		 642 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  31.94 
 
 		 640 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  32.37 
 
 		 643 aa  63.5  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>