72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2330 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  54.89 
 
 		 703 aa  676    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  75.22 
 
 		 683 aa  987    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  74.56 
 
 		 707 aa  1013    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  100 
 
 		 683 aa  1351    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  44.43 
 
 		 654 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  44.53 
 
 		 661 aa  487  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  43.05 
 
 		 653 aa  484  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  43.28 
 
 		 667 aa  465  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  44.43 
 
 		 786 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  41.49 
 
 		 694 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  43.03 
 
 		 683 aa  452  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  41.53 
 
 		 655 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  43.14 
 
 		 657 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  42.54 
 
 		 661 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  43.37 
 
 		 661 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  45.53 
 
 		 660 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  45.76 
 
 		 700 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  41.86 
 
 		 657 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  43.09 
 
 		 793 aa  445  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  42.38 
 
 		 662 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  43.01 
 
 		 657 aa  445  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  45.18 
 
 		 678 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  42.3 
 
 		 662 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  43.35 
 
 		 703 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  41.83 
 
 		 658 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  42.02 
 
 		 665 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  43.51 
 
 		 701 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  42.13 
 
 		 570 aa  361  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  72.43 
 
 		 294 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  39.45 
 
 		 603 aa  350  6e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  45.2 
 
 		 581 aa  310  4e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  44.26 
 
 		 587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  40.57 
 
 		 579 aa  304  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  43.58 
 
 		 583 aa  303  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  39.39 
 
 		 579 aa  302  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  42.34 
 
 		 579 aa  299  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  41.76 
 
 		 583 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  44.47 
 
 		 575 aa  296  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  44.39 
 
 		 587 aa  293  6e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  40.22 
 
 		 579 aa  293  9e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  42.25 
 
 		 625 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  41.7 
 
 		 587 aa  291  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  38.76 
 
 		 579 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  41.51 
 
 		 579 aa  285  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  45.5 
 
 		 603 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  43.71 
 
 		 583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  40.75 
 
 		 579 aa  283  5.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  41.26 
 
 		 579 aa  281  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  41.26 
 
 		 579 aa  281  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  40.66 
 
 		 579 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  41.55 
 
 		 585 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  41.13 
 
 		 579 aa  274  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  41.84 
 
 		 579 aa  273  8.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  39.58 
 
 		 584 aa  272  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  42.17 
 
 		 597 aa  264  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  39.72 
 
 		 578 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  47.4 
 
 		 584 aa  260  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  46.67 
 
 		 584 aa  257  6e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  41.78 
 
 		 573 aa  254  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  42.86 
 
 		 579 aa  254  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  31.74 
 
 		 642 aa  249  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  34.81 
 
 		 643 aa  247  4e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  31.88 
 
 		 640 aa  225  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0854  hypothetical protein  46.54 
 
 		 262 aa  194  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  42.7 
 
 		 218 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0242  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  30.58 
 
 		 526 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.703018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1643  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  30.94 
 
 		 493 aa  124  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1621  hypothetical protein  30.28 
 
 		 516 aa  124  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1320  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  30.28 
 
 		 516 aa  117  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.010689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3388  hypothetical protein  42.22 
 
 		 123 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783489 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  41.27 
 
 		 83 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4856  hypothetical protein  46.15 
 
 		 97 aa  45.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274271  normal  0.0158859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>