72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0359 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  60.28 
 
 		 581 aa  691    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  100 
 
 		 579 aa  1151    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  58.97 
 
 		 583 aa  634  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  58.77 
 
 		 583 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  55.67 
 
 		 583 aa  611  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  56.41 
 
 		 584 aa  590  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  56.87 
 
 		 584 aa  591  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  53.41 
 
 		 603 aa  580  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  55.18 
 
 		 587 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  51.72 
 
 		 625 aa  570  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  53.09 
 
 		 579 aa  567  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  53.26 
 
 		 579 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  52.73 
 
 		 579 aa  564  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  52.73 
 
 		 579 aa  564  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  52.56 
 
 		 579 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  51.28 
 
 		 587 aa  556  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  52.9 
 
 		 579 aa  557  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  52.05 
 
 		 587 aa  555  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  52.58 
 
 		 585 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  51.37 
 
 		 579 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  51.37 
 
 		 579 aa  546  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  52.79 
 
 		 603 aa  544  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  51.03 
 
 		 579 aa  538  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  52.14 
 
 		 579 aa  536  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  51.2 
 
 		 579 aa  535  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  50.42 
 
 		 584 aa  534  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  51.54 
 
 		 578 aa  529  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  51.03 
 
 		 573 aa  530  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  52.4 
 
 		 575 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  52.87 
 
 		 579 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  50.08 
 
 		 597 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  40.76 
 
 		 653 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  41.38 
 
 		 661 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  41.1 
 
 		 683 aa  392  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  39.12 
 
 		 654 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  41.2 
 
 		 662 aa  379  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  47 
 
 		 655 aa  332  8e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  48.61 
 
 		 786 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  46.65 
 
 		 658 aa  324  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  48.35 
 
 		 703 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  46.89 
 
 		 793 aa  320  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  46.62 
 
 		 661 aa  320  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  45.87 
 
 		 657 aa  316  9e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  46.6 
 
 		 678 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  46.58 
 
 		 657 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  47.54 
 
 		 700 aa  312  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  45.8 
 
 		 657 aa  310  5.9999999999999995e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  46.84 
 
 		 661 aa  306  6e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  46.5 
 
 		 660 aa  306  6e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  46.29 
 
 		 667 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  47.89 
 
 		 701 aa  300  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  46.25 
 
 		 665 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  42.92 
 
 		 683 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  42.18 
 
 		 707 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  42.25 
 
 		 570 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  45.54 
 
 		 683 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  40.69 
 
 		 662 aa  266  8.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  45.03 
 
 		 703 aa  259  8e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0854  hypothetical protein  56.36 
 
 		 262 aa  247  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  38.74 
 
 		 694 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  53.21 
 
 		 218 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  36.84 
 
 		 643 aa  207  4e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  34.44 
 
 		 642 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  35.4 
 
 		 640 aa  190  7e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1643  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  32.48 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1621  hypothetical protein  32.72 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0242  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  32.41 
 
 		 526 aa  143  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.703018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1320  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  32.72 
 
 		 516 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.010689 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  39.41 
 
 		 294 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4856  hypothetical protein  64.71 
 
 		 97 aa  107  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274271  normal  0.0158859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  55.56 
 
 		 83 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  26.44 
 
 		 235 aa  43.9  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>