72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0516 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  67.5 
 
 		 597 aa  746    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  74.96 
 
 		 587 aa  900    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  74.66 
 
 		 603 aa  862    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1160    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  57.19 
 
 		 583 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  57.8 
 
 		 583 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  54.07 
 
 		 583 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  54.44 
 
 		 603 aa  590  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  53.81 
 
 		 581 aa  589  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  55.61 
 
 		 579 aa  586  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  53.52 
 
 		 579 aa  586  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  54.24 
 
 		 579 aa  574  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  54.24 
 
 		 579 aa  574  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  54.27 
 
 		 625 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  54.95 
 
 		 585 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  55.18 
 
 		 579 aa  569  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  53.24 
 
 		 579 aa  568  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  54.84 
 
 		 584 aa  569  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  54.33 
 
 		 584 aa  568  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  54.22 
 
 		 587 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  53.79 
 
 		 579 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  53.47 
 
 		 579 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  52.63 
 
 		 579 aa  561  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  54.97 
 
 		 575 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  52.65 
 
 		 579 aa  555  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  51.45 
 
 		 579 aa  549  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  51.83 
 
 		 584 aa  545  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  53.12 
 
 		 578 aa  539  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  51.11 
 
 		 579 aa  541  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  50.34 
 
 		 573 aa  535  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  54.81 
 
 		 579 aa  521  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  40 
 
 		 793 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  40.42 
 
 		 661 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  41.19 
 
 		 661 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  40.18 
 
 		 658 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  41.05 
 
 		 657 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  39.55 
 
 		 655 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  39.45 
 
 		 786 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  39.14 
 
 		 654 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  39.79 
 
 		 703 aa  375  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  40.69 
 
 		 701 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  39.23 
 
 		 657 aa  364  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  47.34 
 
 		 683 aa  320  5e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  46.68 
 
 		 667 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  45.31 
 
 		 678 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  46.9 
 
 		 660 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  44.42 
 
 		 661 aa  303  4.0000000000000003e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  44.9 
 
 		 662 aa  302  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  44.08 
 
 		 657 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  46.08 
 
 		 700 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  44.55 
 
 		 653 aa  299  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  44.63 
 
 		 683 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  45 
 
 		 665 aa  294  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  43.69 
 
 		 707 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  44.42 
 
 		 683 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  45.19 
 
 		 703 aa  277  5e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  41.56 
 
 		 570 aa  276  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  42.82 
 
 		 662 aa  271  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  41.65 
 
 		 694 aa  259  9e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0854  hypothetical protein  54.34 
 
 		 262 aa  237  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  51.8 
 
 		 218 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  37.66 
 
 		 640 aa  196  9e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  40.68 
 
 		 643 aa  195  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  37.03 
 
 		 642 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1643  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  34.32 
 
 		 493 aa  152  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1621  hypothetical protein  31.61 
 
 		 516 aa  140  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0242  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  31.61 
 
 		 526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.703018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1320  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  31.91 
 
 		 516 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.010689 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  42.94 
 
 		 294 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4856  hypothetical protein  51.14 
 
 		 97 aa  75.5  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274271  normal  0.0158859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  44.12 
 
 		 83 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0806  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1115 aa  47.8  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.885506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>