73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0752 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  66.32 
 
 
578 aa  754    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  78.41 
 
 
579 aa  907    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  71.16 
 
 
579 aa  828    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  75.82 
 
 
579 aa  880    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  100 
 
 
625 aa  1255    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  75.82 
 
 
579 aa  880    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  87.05 
 
 
587 aa  994    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  72.88 
 
 
579 aa  842    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  63.56 
 
 
603 aa  729    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  71.33 
 
 
579 aa  842    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  83.59 
 
 
585 aa  964    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  58.28 
 
 
575 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  67.01 
 
 
579 aa  718    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  71.92 
 
 
584 aa  829    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  83.22 
 
 
579 aa  969    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  74.44 
 
 
579 aa  864    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  64.77 
 
 
579 aa  764    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  74.27 
 
 
579 aa  850    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  64.94 
 
 
579 aa  771    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  56.8 
 
 
583 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  53.92 
 
 
583 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  54.33 
 
 
587 aa  598  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  52.41 
 
 
583 aa  588  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  53.45 
 
 
603 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  53 
 
 
581 aa  578  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  54.25 
 
 
587 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  53.25 
 
 
584 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  52.37 
 
 
584 aa  570  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  51.55 
 
 
579 aa  568  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  53.58 
 
 
597 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  49.83 
 
 
573 aa  511  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  40.27 
 
 
654 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  38.43 
 
 
653 aa  395  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  39.79 
 
 
657 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  38.47 
 
 
793 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  39.97 
 
 
657 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  43.29 
 
 
658 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  44.21 
 
 
655 aa  320  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  37.44 
 
 
662 aa  319  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  42.27 
 
 
661 aa  317  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0854  hypothetical protein  68.35 
 
 
262 aa  317  6e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  68.49 
 
 
218 aa  312  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  42.72 
 
 
661 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  44.42 
 
 
700 aa  310  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  41.69 
 
 
678 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  42.48 
 
 
703 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  43.32 
 
 
786 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  43.23 
 
 
683 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  42.31 
 
 
660 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  44.22 
 
 
667 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  42.25 
 
 
657 aa  303  8.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  40.47 
 
 
701 aa  297  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  43.35 
 
 
661 aa  296  6e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  40.53 
 
 
665 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  41.75 
 
 
707 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  42.12 
 
 
683 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  36.47 
 
 
662 aa  284  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  35.87 
 
 
570 aa  281  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  40.77 
 
 
683 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  44.48 
 
 
703 aa  261  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  40.97 
 
 
694 aa  260  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  31.5 
 
 
642 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  35.24 
 
 
643 aa  179  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  31.01 
 
 
640 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1643  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  32.04 
 
 
493 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0242  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  30.56 
 
 
526 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.703018  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1621  hypothetical protein  31.6 
 
 
516 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  41.03 
 
 
294 aa  138  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1320  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  31.06 
 
 
516 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.010689 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4856  hypothetical protein  67.82 
 
 
97 aa  121  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274271  normal  0.0158859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  49.02 
 
 
83 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3388  hypothetical protein  33.82 
 
 
123 aa  55.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0783489 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7038  Relaxase/mobilization nuclease family protein  29.13 
 
 
490 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>