59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1997 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  77.78 
 
 		 661 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  76.19 
 
 		 786 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  74.6 
 
 		 657 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  74.6 
 
 		 678 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  74.6 
 
 		 657 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  74.6 
 
 		 667 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  74.6 
 
 		 665 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  67.61 
 
 		 703 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  73.02 
 
 		 661 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  73.02 
 
 		 683 aa  93.6  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  69.84 
 
 		 793 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  69.84 
 
 		 658 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  66.67 
 
 		 700 aa  87.8  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  75.93 
 
 		 657 aa  87.8  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  72.22 
 
 		 655 aa  87.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  64.62 
 
 		 654 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  63.49 
 
 		 653 aa  84.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  72.22 
 
 		 701 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  63.49 
 
 		 660 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  61.67 
 
 		 662 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  48.48 
 
 		 584 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  50 
 
 		 584 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  50 
 
 		 583 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  47.89 
 
 		 579 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  51.56 
 
 		 583 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  51.56 
 
 		 581 aa  64.7  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  55.56 
 
 		 579 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  45.59 
 
 		 661 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  46.55 
 
 		 585 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  50 
 
 		 587 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  46.88 
 
 		 583 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  44.62 
 
 		 587 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  42.86 
 
 		 707 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  48.44 
 
 		 579 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  49.02 
 
 		 579 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  43.66 
 
 		 578 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  44.64 
 
 		 579 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  50.98 
 
 		 579 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  49.02 
 
 		 625 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  46.3 
 
 		 579 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  38.1 
 
 		 683 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  47.06 
 
 		 579 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  44.12 
 
 		 587 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  41.27 
 
 		 575 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  47.06 
 
 		 579 aa  57.8  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  48.15 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  44.62 
 
 		 579 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  44.62 
 
 		 579 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  43.75 
 
 		 603 aa  57.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  36.36 
 
 		 294 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  47.06 
 
 		 579 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  42.11 
 
 		 579 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  41.27 
 
 		 683 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  45.83 
 
 		 694 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  38.6 
 
 		 603 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  34.25 
 
 		 662 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  39.73 
 
 		 584 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  42.22 
 
 		 573 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>