73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2875 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  72.35 
 
 		 584 aa  830    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1164    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  87.22 
 
 		 625 aa  1009    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  78.83 
 
 		 579 aa  904    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  72.98 
 
 		 579 aa  842    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  76.59 
 
 		 579 aa  883    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  73.84 
 
 		 579 aa  862    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  76.59 
 
 		 579 aa  883    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  73.32 
 
 		 579 aa  846    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  63.17 
 
 		 603 aa  719    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  84.16 
 
 		 585 aa  972    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  58.93 
 
 		 575 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  83.28 
 
 		 579 aa  958    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  67.13 
 
 		 579 aa  714    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  67.64 
 
 		 578 aa  763    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  75.04 
 
 		 579 aa  863    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  75.73 
 
 		 579 aa  862    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  66.44 
 
 		 579 aa  776    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  66.61 
 
 		 579 aa  773    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  57.36 
 
 		 583 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  54.68 
 
 		 583 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  54.67 
 
 		 583 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  53.29 
 
 		 587 aa  588  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  55.26 
 
 		 603 aa  579  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  52.99 
 
 		 581 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  54.55 
 
 		 587 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  53.91 
 
 		 584 aa  567  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  51.37 
 
 		 579 aa  562  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  52.03 
 
 		 584 aa  561  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  52.42 
 
 		 597 aa  537  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  49.23 
 
 		 573 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  38.61 
 
 		 653 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  41.1 
 
 		 700 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  39.67 
 
 		 658 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  40.12 
 
 		 655 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  39.52 
 
 		 793 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  39.49 
 
 		 678 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  39.72 
 
 		 657 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  39.82 
 
 		 660 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  39.38 
 
 		 683 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  37.65 
 
 		 657 aa  360  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  37.9 
 
 		 667 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0854  hypothetical protein  69.27 
 
 		 262 aa  321  3e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  41.77 
 
 		 661 aa  319  7e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  42.39 
 
 		 661 aa  315  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  44.23 
 
 		 786 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  44.23 
 
 		 654 aa  311  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  44.5 
 
 		 703 aa  309  9e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  43.49 
 
 		 657 aa  307  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  44.41 
 
 		 701 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  65.16 
 
 		 218 aa  303  7.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  42.25 
 
 		 662 aa  299  8e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  42.12 
 
 		 661 aa  293  6e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  42.82 
 
 		 665 aa  292  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  41.7 
 
 		 683 aa  283  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  42.28 
 
 		 662 aa  279  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  40.33 
 
 		 707 aa  272  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  42.24 
 
 		 683 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  42.13 
 
 		 694 aa  263  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  40.58 
 
 		 570 aa  260  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  44.66 
 
 		 703 aa  260  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  35.9 
 
 		 643 aa  188  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  29.64 
 
 		 642 aa  186  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  32.02 
 
 		 640 aa  184  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1643  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  30.7 
 
 		 493 aa  154  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1621  hypothetical protein  31.15 
 
 		 516 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0242  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  31.15 
 
 		 526 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.703018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1320  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  29.52 
 
 		 516 aa  133  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.010689 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4856  hypothetical protein  71.26 
 
 		 97 aa  126  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274271  normal  0.0158859 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  38.95 
 
 		 294 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  44.64 
 
 		 83 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3388  hypothetical protein  33.08 
 
 		 123 aa  50.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783489 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7038  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.46 
 
 		 490 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>