70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2343 on replicon NC_011061
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  100 
 
 
640 aa  1303    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  43.03 
 
 
642 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  44.41 
 
 
643 aa  474  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  34.33 
 
 
700 aa  269  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  34.67 
 
 
661 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  34.58 
 
 
661 aa  267  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  35.13 
 
 
786 aa  267  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  35.13 
 
 
657 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  34.15 
 
 
662 aa  264  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  34.19 
 
 
793 aa  263  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  34.7 
 
 
678 aa  263  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  33.59 
 
 
653 aa  262  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  33.87 
 
 
658 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  33.98 
 
 
655 aa  262  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  35.1 
 
 
660 aa  261  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  34.7 
 
 
657 aa  259  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  34.63 
 
 
667 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  34.47 
 
 
701 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  33.5 
 
 
657 aa  257  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  34.7 
 
 
683 aa  256  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  34.35 
 
 
703 aa  253  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  30.86 
 
 
662 aa  253  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  33.04 
 
 
661 aa  252  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  33.38 
 
 
654 aa  250  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  34.1 
 
 
665 aa  244  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  32.06 
 
 
703 aa  233  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  34.87 
 
 
570 aa  232  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  32.34 
 
 
707 aa  231  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  33.17 
 
 
683 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  31.88 
 
 
683 aa  220  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  30.82 
 
 
694 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  35.7 
 
 
603 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  35.31 
 
 
581 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  35.86 
 
 
583 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  39.62 
 
 
587 aa  187  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  34.95 
 
 
579 aa  187  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  32.61 
 
 
583 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  33.57 
 
 
579 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  31.42 
 
 
587 aa  183  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  37.3 
 
 
587 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  31.82 
 
 
578 aa  180  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  32.7 
 
 
584 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  38.02 
 
 
579 aa  179  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  34.99 
 
 
575 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  32.78 
 
 
584 aa  176  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  32.8 
 
 
585 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  33.77 
 
 
579 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  37.5 
 
 
603 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  35.81 
 
 
573 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  32.18 
 
 
625 aa  173  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  37.78 
 
 
579 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  36.42 
 
 
579 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  32.56 
 
 
583 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  37.26 
 
 
579 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  30.5 
 
 
579 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  34.2 
 
 
579 aa  166  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  34.2 
 
 
579 aa  166  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  35.13 
 
 
579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  32.65 
 
 
597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  33.72 
 
 
579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  31.81 
 
 
584 aa  164  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  33.87 
 
 
579 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0854  hypothetical protein  43.35 
 
 
262 aa  156  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1643  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  31 
 
 
493 aa  151  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0242  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  28.61 
 
 
526 aa  126  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.703018  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1621  hypothetical protein  28.32 
 
 
516 aa  125  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1320  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  28.14 
 
 
516 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.010689 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  31.94 
 
 
294 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  32.2 
 
 
218 aa  44.7  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0806  hypothetical protein  27.93 
 
 
1115 aa  44.3  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.885506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>