18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0806 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0806  hypothetical protein  100 
 
 
1115 aa  2274    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.885506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  26.67 
 
 
603 aa  50.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  31.78 
 
 
642 aa  48.9  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  26.35 
 
 
575 aa  48.5  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  25.44 
 
 
587 aa  47.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  25.32 
 
 
657 aa  47  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  28.28 
 
 
584 aa  47  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  27.59 
 
 
579 aa  47  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  27.59 
 
 
579 aa  47  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  26.85 
 
 
603 aa  46.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  27.21 
 
 
579 aa  46.2  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  25.86 
 
 
643 aa  45.8  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4359  relaxase/mobilization nuclease family protein  29.67 
 
 
400 aa  45.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.738974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  30.19 
 
 
661 aa  45.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  27.18 
 
 
583 aa  45.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  25 
 
 
579 aa  45.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  24.31 
 
 
579 aa  44.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  30.19 
 
 
667 aa  44.7  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>