73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_35930 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  90.66 
 
 
683 aa  1158    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  88.14 
 
 
703 aa  1118    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  90.74 
 
 
661 aa  1151    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  89.51 
 
 
657 aa  1133    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  87.83 
 
 
657 aa  1110    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  67.68 
 
 
653 aa  894    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  85.82 
 
 
662 aa  1118    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  88.54 
 
 
678 aa  1135    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  88.39 
 
 
793 aa  1147    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  82.88 
 
 
657 aa  1102    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  89.2 
 
 
786 aa  1139    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  87.98 
 
 
655 aa  1132    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  89.01 
 
 
667 aa  1159    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  88.27 
 
 
665 aa  1111    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  90.17 
 
 
658 aa  1160    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  87.04 
 
 
700 aa  1095    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  86.52 
 
 
701 aa  1083    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  58.4 
 
 
654 aa  760    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  83.56 
 
 
660 aa  1060    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  100 
 
 
661 aa  1318    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  50.17 
 
 
570 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  42.11 
 
 
661 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  45.71 
 
 
683 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  42.69 
 
 
683 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  42.25 
 
 
707 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  43.51 
 
 
662 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  41.38 
 
 
694 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  40.24 
 
 
603 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  40.21 
 
 
587 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  41.33 
 
 
703 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  40.15 
 
 
587 aa  395  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  40.18 
 
 
585 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  37.78 
 
 
597 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  45.5 
 
 
579 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  47.04 
 
 
579 aa  322  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  42.14 
 
 
578 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  45.24 
 
 
581 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  44.42 
 
 
579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  35.29 
 
 
573 aa  314  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  45.02 
 
 
579 aa  313  6.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  43.79 
 
 
579 aa  312  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  44.85 
 
 
603 aa  310  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  45.65 
 
 
579 aa  310  5e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  42.27 
 
 
625 aa  310  5.9999999999999995e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  44.26 
 
 
583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  42.39 
 
 
587 aa  307  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  38.69 
 
 
575 aa  308  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  40.73 
 
 
583 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  43.82 
 
 
583 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  43.03 
 
 
579 aa  304  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  43.63 
 
 
579 aa  303  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  43.63 
 
 
579 aa  303  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  42.32 
 
 
579 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  41.26 
 
 
579 aa  296  7e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  44.59 
 
 
579 aa  295  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  41.31 
 
 
584 aa  286  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  41.74 
 
 
579 aa  284  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  42.46 
 
 
584 aa  272  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  42.89 
 
 
584 aa  272  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  34.72 
 
 
643 aa  263  8e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  33.04 
 
 
640 aa  261  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  30.57 
 
 
642 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0854  hypothetical protein  51.83 
 
 
262 aa  236  8e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  46.15 
 
 
294 aa  183  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1643  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  31.09 
 
 
493 aa  159  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  50 
 
 
218 aa  153  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1621  hypothetical protein  30.24 
 
 
516 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0242  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  32.09 
 
 
526 aa  147  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.703018  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1320  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  30.38 
 
 
516 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.010689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3718  VirD2 components relaxase  85.71 
 
 
70 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  77.78 
 
 
83 aa  98.6  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3388  hypothetical protein  34.69 
 
 
123 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0783489 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0806  hypothetical protein  30.19 
 
 
1115 aa  45.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.885506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>