71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2806 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  74.27 
 
 
625 aa  855    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  73.58 
 
 
579 aa  834    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  62.87 
 
 
603 aa  712    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  74.44 
 
 
585 aa  845    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  57.9 
 
 
575 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  72.02 
 
 
579 aa  827    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  72.02 
 
 
579 aa  827    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  67.88 
 
 
579 aa  717    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  69.52 
 
 
584 aa  785    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  68.05 
 
 
578 aa  762    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  74.09 
 
 
579 aa  840    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  73.75 
 
 
579 aa  840    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  75.73 
 
 
587 aa  857    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  73.23 
 
 
579 aa  842    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1146    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  65.28 
 
 
579 aa  773    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  73.18 
 
 
579 aa  841    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  75.65 
 
 
579 aa  865    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  64.94 
 
 
579 aa  761    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  55.37 
 
 
583 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  54.87 
 
 
583 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  52.9 
 
 
587 aa  578  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  54.19 
 
 
583 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  53.24 
 
 
587 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  52.66 
 
 
581 aa  566  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  52.22 
 
 
584 aa  561  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  55.12 
 
 
584 aa  564  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  53.91 
 
 
603 aa  561  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  51.2 
 
 
579 aa  534  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  50.58 
 
 
597 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  49.06 
 
 
573 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  39.85 
 
 
653 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  39.69 
 
 
657 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0854  hypothetical protein  67.93 
 
 
262 aa  324  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  41.02 
 
 
657 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  66.67 
 
 
218 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  44.42 
 
 
655 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  42.04 
 
 
661 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  43.24 
 
 
660 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  43.38 
 
 
661 aa  303  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  44.28 
 
 
786 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  42.79 
 
 
658 aa  303  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  43.74 
 
 
654 aa  302  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  43.45 
 
 
700 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  43.98 
 
 
683 aa  300  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  40.99 
 
 
703 aa  299  8e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  41.01 
 
 
667 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  40.25 
 
 
701 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  41.09 
 
 
657 aa  296  8e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  41.69 
 
 
678 aa  296  9e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  40 
 
 
661 aa  293  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  42.68 
 
 
793 aa  293  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  40 
 
 
662 aa  290  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  40.52 
 
 
707 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  44.01 
 
 
662 aa  287  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  43.41 
 
 
665 aa  287  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  40 
 
 
683 aa  282  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  41.04 
 
 
683 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  44.26 
 
 
703 aa  266  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  38.62 
 
 
570 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  40.05 
 
 
694 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  32.58 
 
 
640 aa  189  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  33.42 
 
 
642 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  37.72 
 
 
643 aa  179  9e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1643  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  31.04 
 
 
493 aa  158  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1621  hypothetical protein  30.34 
 
 
516 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0242  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  31.56 
 
 
526 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.703018  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1320  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  30.57 
 
 
516 aa  137  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.010689 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4856  hypothetical protein  72.41 
 
 
97 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274271  normal  0.0158859 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  37.44 
 
 
294 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  46.3 
 
 
83 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>