73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0702 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  73.75 
 
 
579 aa  837    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  62.35 
 
 
603 aa  724    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  77.03 
 
 
585 aa  875    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  60.17 
 
 
575 aa  653    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  75.82 
 
 
579 aa  867    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  82.73 
 
 
579 aa  932    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  82.73 
 
 
579 aa  932    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  68.74 
 
 
579 aa  727    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  77.74 
 
 
584 aa  871    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  67.88 
 
 
578 aa  768    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  75.3 
 
 
579 aa  857    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1142    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  78.41 
 
 
625 aa  907    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  78.83 
 
 
587 aa  894    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  74.09 
 
 
579 aa  853    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  77.16 
 
 
579 aa  890    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  77.03 
 
 
579 aa  880    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  63.04 
 
 
579 aa  742    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  63.9 
 
 
579 aa  757    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  56.75 
 
 
583 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  56.48 
 
 
587 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  56.78 
 
 
583 aa  615  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  53.78 
 
 
583 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  54.44 
 
 
603 aa  586  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  55.27 
 
 
587 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  54.73 
 
 
584 aa  570  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  53.78 
 
 
584 aa  571  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  53.94 
 
 
581 aa  568  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  50.69 
 
 
579 aa  547  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  53.18 
 
 
597 aa  542  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  49.06 
 
 
573 aa  500  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  41.42 
 
 
654 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0854  hypothetical protein  72.02 
 
 
262 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  45.13 
 
 
655 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  45.16 
 
 
786 aa  326  9e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  43.71 
 
 
658 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  43.79 
 
 
661 aa  322  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  44.36 
 
 
661 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  44.58 
 
 
700 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  44.91 
 
 
703 aa  320  5e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  41.96 
 
 
683 aa  318  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  44.72 
 
 
657 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  45.05 
 
 
667 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  43.6 
 
 
660 aa  316  6e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  40 
 
 
793 aa  316  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  42.11 
 
 
657 aa  316  9e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  42.79 
 
 
678 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  68.49 
 
 
218 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  45.65 
 
 
701 aa  313  7.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  43.81 
 
 
657 aa  312  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  43 
 
 
662 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  37.57 
 
 
653 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  44.09 
 
 
661 aa  303  5.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  42.76 
 
 
665 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  39.39 
 
 
683 aa  296  8e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  44.36 
 
 
662 aa  293  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  41.45 
 
 
707 aa  292  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  45.07 
 
 
683 aa  280  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  44.88 
 
 
703 aa  272  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  41.98 
 
 
570 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  41.03 
 
 
694 aa  262  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  36.89 
 
 
643 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  35.24 
 
 
642 aa  181  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  32.07 
 
 
640 aa  167  6.9999999999999995e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1643  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  32.23 
 
 
493 aa  157  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  44.64 
 
 
294 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1621  hypothetical protein  30.75 
 
 
516 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0242  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  30.75 
 
 
526 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.703018  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1320  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  27.8 
 
 
516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.010689 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4856  hypothetical protein  68.97 
 
 
97 aa  123  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274271  normal  0.0158859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  48.44 
 
 
83 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3388  hypothetical protein  31.62 
 
 
123 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0783489 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0806  hypothetical protein  27.21 
 
 
1115 aa  46.2  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.885506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>