49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3388 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3388  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  244  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  46.56 
 
 		 707 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  43.41 
 
 		 294 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  40.74 
 
 		 683 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  42.22 
 
 		 683 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  33.82 
 
 		 625 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  34.62 
 
 		 579 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  36.92 
 
 		 603 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  33.09 
 
 		 579 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  35.71 
 
 		 579 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  32.28 
 
 		 583 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  33.08 
 
 		 587 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  33.07 
 
 		 654 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  31.25 
 
 		 579 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  31.25 
 
 		 579 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  33.58 
 
 		 597 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  33.98 
 
 		 657 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  31.54 
 
 		 585 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  32.67 
 
 		 678 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  35.71 
 
 		 657 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  36.73 
 
 		 667 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  31.58 
 
 		 661 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  34.69 
 
 		 661 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  35.71 
 
 		 786 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  30.16 
 
 		 581 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  31.62 
 
 		 579 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  35.64 
 
 		 660 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  35.71 
 
 		 703 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  33.67 
 
 		 793 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  32.28 
 
 		 573 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  33.67 
 
 		 665 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  28.24 
 
 		 584 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  33.67 
 
 		 661 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  34.69 
 
 		 683 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  30.15 
 
 		 579 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  33.67 
 
 		 658 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  29.13 
 
 		 579 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  34.69 
 
 		 653 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  31.01 
 
 		 579 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  28.46 
 
 		 587 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  29.92 
 
 		 583 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  29.13 
 
 		 579 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  30.95 
 
 		 703 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  28.35 
 
 		 584 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  31.5 
 
 		 603 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  28.44 
 
 		 584 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  32.32 
 
 		 700 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  57.58 
 
 		 579 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  27.21 
 
 		 218 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.166171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>