71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4008 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  74.09 
 
 		 579 aa  856    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  67.36 
 
 		 578 aa  769    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  69.69 
 
 		 584 aa  804    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  73.4 
 
 		 579 aa  850    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  65.98 
 
 		 579 aa  768    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  74.09 
 
 		 579 aa  856    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  62.18 
 
 		 603 aa  714    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  68.62 
 
 		 579 aa  730    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  66.32 
 
 		 579 aa  764    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  72.54 
 
 		 585 aa  834    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  71.11 
 
 		 579 aa  835    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  73.23 
 
 		 579 aa  838    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  85.84 
 
 		 579 aa  971    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  74.09 
 
 		 579 aa  853    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  78.24 
 
 		 579 aa  901    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  57.93 
 
 		 575 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  71.33 
 
 		 625 aa  843    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  73.84 
 
 		 587 aa  855    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  100 
 
 		 579 aa  1149    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  55.44 
 
 		 583 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  54.48 
 
 		 583 aa  589  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  54.15 
 
 		 587 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  53.77 
 
 		 583 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  55.46 
 
 		 584 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  53.87 
 
 		 581 aa  571  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  53.49 
 
 		 603 aa  568  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  53.2 
 
 		 584 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  53.22 
 
 		 587 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  52.65 
 
 		 579 aa  561  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  53.26 
 
 		 597 aa  541  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  50 
 
 		 573 aa  513  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  40.52 
 
 		 654 aa  420  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  38.59 
 
 		 653 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  45.15 
 
 		 658 aa  340  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  46.31 
 
 		 661 aa  334  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  45.13 
 
 		 655 aa  334  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  44.74 
 
 		 660 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  44.31 
 
 		 661 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  45.3 
 
 		 700 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  45.81 
 
 		 786 aa  330  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  47 
 
 		 683 aa  329  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  46.21 
 
 		 667 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  44.58 
 
 		 657 aa  327  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0854  hypothetical protein  70.37 
 
 		 262 aa  326  6e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  44.66 
 
 		 703 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  44.34 
 
 		 701 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  43.06 
 
 		 678 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  42.55 
 
 		 793 aa  321  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  43.61 
 
 		 657 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  44.5 
 
 		 662 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  43.31 
 
 		 657 aa  320  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  43.66 
 
 		 665 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  65.3 
 
 		 218 aa  299  8e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  41.12 
 
 		 707 aa  296  6e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  41.48 
 
 		 661 aa  287  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  39.91 
 
 		 683 aa  286  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  44.1 
 
 		 703 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  40.09 
 
 		 683 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  40.95 
 
 		 570 aa  272  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  43.22 
 
 		 662 aa  270  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  40.79 
 
 		 694 aa  263  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  34.53 
 
 		 643 aa  174  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  31.85 
 
 		 640 aa  172  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  31.01 
 
 		 642 aa  171  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1643  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  30.59 
 
 		 493 aa  157  6e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1621  hypothetical protein  29.67 
 
 		 516 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0242  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  29.64 
 
 		 526 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.703018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4856  hypothetical protein  72.16 
 
 		 97 aa  133  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274271  normal  0.0158859 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1320  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  30.09 
 
 		 516 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.010689 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  36.36 
 
 		 294 aa  127  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  49.02 
 
 		 83 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>