73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1489 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  87.33 
 
 		 683 aa  1137    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  88.49 
 
 		 703 aa  1179    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  91.49 
 
 		 657 aa  1152    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  88.85 
 
 		 657 aa  1122    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  93.34 
 
 		 678 aa  1216    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  90.87 
 
 		 655 aa  1174    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  69.79 
 
 		 653 aa  917    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  82.64 
 
 		 662 aa  1061    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  90.46 
 
 		 793 aa  1240    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  90.46 
 
 		 661 aa  1133    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  82.32 
 
 		 657 aa  1090    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  91.31 
 
 		 786 aa  1227    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  87.42 
 
 		 661 aa  1128    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  86.81 
 
 		 667 aa  1124    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  86.71 
 
 		 665 aa  1068    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  88.85 
 
 		 660 aa  1111    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  91.46 
 
 		 658 aa  1172    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  100 
 
 		 700 aa  1400    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  88.56 
 
 		 701 aa  1174    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  57.38 
 
 		 654 aa  745    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  51.04 
 
 		 570 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  42.73 
 
 		 661 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  42.39 
 
 		 707 aa  465  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  45.78 
 
 		 683 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  43.32 
 
 		 683 aa  458  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  44.23 
 
 		 662 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  42.47 
 
 		 694 aa  438  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  42.64 
 
 		 579 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  41.75 
 
 		 583 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  41.8 
 
 		 583 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  41.47 
 
 		 703 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  41.51 
 
 		 587 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  40.48 
 
 		 578 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  37.65 
 
 		 597 aa  333  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  45.43 
 
 		 579 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  45.35 
 
 		 579 aa  325  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  43.19 
 
 		 603 aa  325  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  47.62 
 
 		 579 aa  324  3e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  42.6 
 
 		 579 aa  324  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  44.08 
 
 		 579 aa  322  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  42.8 
 
 		 625 aa  320  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  42.02 
 
 		 583 aa  320  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  46.73 
 
 		 587 aa  319  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  44.67 
 
 		 585 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  44.39 
 
 		 579 aa  317  6e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  44.39 
 
 		 579 aa  317  6e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  40.79 
 
 		 575 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  43.62 
 
 		 579 aa  314  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  45.03 
 
 		 581 aa  311  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  36.83 
 
 		 584 aa  309  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  43.78 
 
 		 603 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  41.56 
 
 		 579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  44.84 
 
 		 587 aa  308  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  45.19 
 
 		 579 aa  303  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  42.42 
 
 		 579 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  45.92 
 
 		 579 aa  296  8e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  43.83 
 
 		 573 aa  291  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  34.33 
 
 		 640 aa  278  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  43.03 
 
 		 584 aa  276  9e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  42.2 
 
 		 584 aa  273  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  32.2 
 
 		 642 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  35.26 
 
 		 643 aa  263  8e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0854  hypothetical protein  54.13 
 
 		 262 aa  241  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  45.5 
 
 		 294 aa  181  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0242  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  32.34 
 
 		 526 aa  156  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.703018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  49.1 
 
 		 218 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1643  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  31.32 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1621  hypothetical protein  30.42 
 
 		 516 aa  155  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1320  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  31.97 
 
 		 516 aa  147  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.010689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3718  VirD2 components relaxase  90 
 
 		 70 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  66.67 
 
 		 83 aa  87.8  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2334  hypothetical protein  85.71 
 
 		 118 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4856  hypothetical protein  35.71 
 
 		 97 aa  44.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274271  normal  0.0158859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>