71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4171 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  67.68 
 
 		 661 aa  872    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  69.77 
 
 		 657 aa  875    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  68.89 
 
 		 657 aa  863    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  69.31 
 
 		 678 aa  878    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  67.95 
 
 		 655 aa  864    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  100 
 
 		 653 aa  1303    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  65.69 
 
 		 662 aa  841    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  67.92 
 
 		 793 aa  867    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  68.84 
 
 		 665 aa  855    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  68.83 
 
 		 660 aa  862    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  67.28 
 
 		 657 aa  880    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  69.95 
 
 		 786 aa  884    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  68.45 
 
 		 667 aa  893    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  68.92 
 
 		 703 aa  860    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  67.58 
 
 		 683 aa  868    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  69.34 
 
 		 661 aa  869    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  69.37 
 
 		 658 aa  884    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  69.92 
 
 		 700 aa  878    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  67.95 
 
 		 701 aa  857    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  59.97 
 
 		 654 aa  775    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  50.97 
 
 		 570 aa  524  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  43.05 
 
 		 683 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  45.49 
 
 		 683 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  43.94 
 
 		 661 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  41.38 
 
 		 707 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  43.52 
 
 		 662 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  44.93 
 
 		 703 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  40.92 
 
 		 694 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  39.97 
 
 		 583 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  39.24 
 
 		 583 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  40.45 
 
 		 579 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  40.8 
 
 		 579 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  38.59 
 
 		 579 aa  392  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  38.34 
 
 		 603 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  38.43 
 
 		 625 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  39.05 
 
 		 585 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  37.56 
 
 		 579 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  39.26 
 
 		 579 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  39.9 
 
 		 579 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  39.9 
 
 		 579 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  38.92 
 
 		 579 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  38.61 
 
 		 587 aa  379  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  39.85 
 
 		 579 aa  375  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  39.14 
 
 		 578 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  40.1 
 
 		 579 aa  362  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  35.52 
 
 		 579 aa  347  5e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  35.73 
 
 		 579 aa  342  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  35.57 
 
 		 573 aa  313  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  37.57 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  43.34 
 
 		 587 aa  290  7e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  43.83 
 
 		 587 aa  287  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  42.51 
 
 		 603 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  38.29 
 
 		 575 aa  281  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  42.46 
 
 		 584 aa  280  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  41.86 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  45.21 
 
 		 597 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  37.16 
 
 		 584 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  42.42 
 
 		 583 aa  263  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  33.59 
 
 		 640 aa  262  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  36.8 
 
 		 584 aa  259  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  30.32 
 
 		 642 aa  251  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  34.46 
 
 		 643 aa  250  5e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0854  hypothetical protein  48.85 
 
 		 262 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0039  hypothetical protein  41.67 
 
 		 294 aa  180  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  49.4 
 
 		 218 aa  159  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0242  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  32.2 
 
 		 526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.703018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1643  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  31.69 
 
 		 493 aa  147  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1621  hypothetical protein  31.92 
 
 		 516 aa  147  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1320  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  31.92 
 
 		 516 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.010689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3718  VirD2 components relaxase  72.86 
 
 		 70 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  63.49 
 
 		 83 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>