38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2643 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2643  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2- like  100 
 
 		 337 aa  679    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1768  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like  84.27 
 
 		 337 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.546869 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6491  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  70.24 
 
 		 337 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.440209  normal  0.634473 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0462  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like  68.83 
 
 		 349 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0176  Relaxase/mobilization nuclease family protein  65.33 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0486311 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3327  plasmid-related protein  59.21 
 
 		 351 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4188  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  58.88 
 
 		 351 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4839  plasmid-related protein  59.21 
 
 		 351 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.658809  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0791  plasmid-related protein  54.17 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0308  plasmid-related protein  54.17 
 
 		 344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0760  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  53.57 
 
 		 344 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6340  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  46.04 
 
 		 367 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.271931 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0785  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  41.78 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00514005 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0017  hypothetical protein  40.37 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.125294 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5017  relaxase/mobilization nuclease family protein  41.59 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4934  relaxase/mobilization nuclease family protein  34.33 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421912  normal  0.821482 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4977  hypothetical protein  40.82 
 
 		 377 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2249  Relaxase/mobilization nuclease family protein  38.75 
 
 		 368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4526  hypothetical protein  35.25 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5826  hypothetical protein  40.39 
 
 		 363 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4359  relaxase/mobilization nuclease family protein  36.53 
 
 		 400 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.738974 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0150  Cpp17  27.67 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000847879  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a001  nickase/relaxase  34.08 
 
 		 438 aa  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0555425  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0012  cpp17  32.22 
 
 		 462 aa  95.5  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000347998  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6229  hypothetical protein  42.22 
 
 		 668 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.422278 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4768  hypothetical protein  26.42 
 
 		 996 aa  67  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439128  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4553  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.57 
 
 		 994 aa  66.2  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9808  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.67 
 
 		 920 aa  66.2  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8212  type IV secretion system T-DNA border endonuclease VirD2  29.95 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4527  hypothetical protein  28.21 
 
 		 745 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.820483  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0031  nickase  30.98 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.743382  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4269  hypothetical protein  27.35 
 
 		 776 aa  59.7  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.516015  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0106  relaxase/Mobilization nuclease domain protein  27.47 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392069  normal  0.357718 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4166  hypothetical protein  29.63 
 
 		 895 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6382  hypothetical protein  30.56 
 
 		 830 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3989  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.55 
 
 		 777 aa  52.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3656  relaxase/mobilization nuclease family protein  29.59 
 
 		 777 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0486452  decreased coverage  0.000000302342 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3793  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  34.23 
 
 		 736 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00267002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>