20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3325 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4841  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  685    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3325  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  685    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4190  hypothetical protein  98.81 
 
 		 336 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2645  putative DNA primase, DNA transfer TraO- like protein  57.82 
 
 		 495 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0460  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  51.85 
 
 		 524 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.919355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1766  putative DNA primase, DNA transfer TraO- like protein  54.48 
 
 		 506 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0683835  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0174  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  46.28 
 
 		 529 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85378  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6493  putative DNA primase, DNA transfer TraO-like protein  55.03 
 
 		 507 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.255427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5018  hypothetical protein  41.24 
 
 		 428 aa  82.8  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4999  hypothetical protein  29.75 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0860  hypothetical protein  34.45 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7521  hypothetical protein  29.03 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952259  normal  0.397074 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1675  hypothetical protein  38.89 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.25502 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6336  hypothetical protein  29.79 
 
 		 559 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0246  hypothetical protein  28.93 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0989  MobA/MobL protein  32.89 
 
 		 430 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5824  hypothetical protein  29.67 
 
 		 402 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4768  hypothetical protein  26.49 
 
 		 996 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439128  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4553  relaxase/mobilization nuclease family protein  32.86 
 
 		 994 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4367  hypothetical protein  35 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>