58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0989 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  100 
 
 		 866 aa  1768    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0871  hypothetical protein  27.94 
 
 		 458 aa  161  4e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0242601 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  29.37 
 
 		 458 aa  151  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1359  hypothetical protein  28.07 
 
 		 542 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2834  hypothetical protein  27.76 
 
 		 520 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  28.06 
 
 		 813 aa  115  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03960  hypothetical protein  24.93 
 
 		 422 aa  113  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.23056  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  24.34 
 
 		 848 aa  108  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0243  hypothetical protein  22.18 
 
 		 509 aa  103  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2603  hypothetical protein  22.8 
 
 		 517 aa  94.4  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  23.47 
 
 		 815 aa  87.4  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  44.64 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  46.07 
 
 		 763 aa  75.1  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  46.07 
 
 		 763 aa  74.7  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  26.18 
 
 		 782 aa  74.3  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  46.07 
 
 		 273 aa  73.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  28.74 
 
 		 1287 aa  72.4  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  24 
 
 		 616 aa  69.7  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  39.17 
 
 		 890 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  39.17 
 
 		 890 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  43.53 
 
 		 878 aa  68.9  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  24.26 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  41.11 
 
 		 929 aa  64.7  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  22.98 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  63.9  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  63.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  41.24 
 
 		 895 aa  63.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  46.05 
 
 		 776 aa  63.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  36.61 
 
 		 681 aa  61.6  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  36.61 
 
 		 681 aa  62  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00297  hypothetical protein  24.1 
 
 		 701 aa  61.2  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  31.97 
 
 		 777 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3238  hypothetical protein  22.5 
 
 		 947 aa  60.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0772641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  36.61 
 
 		 678 aa  60.1  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  34.96 
 
 		 899 aa  59.7  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  25.22 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  32.48 
 
 		 575 aa  58.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  38.2 
 
 		 777 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  38.2 
 
 		 777 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  38.2 
 
 		 777 aa  58.5  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  33.83 
 
 		 847 aa  57.8  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  26.7 
 
 		 466 aa  57  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  36.9 
 
 		 777 aa  55.5  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  23.08 
 
 		 718 aa  55.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  37.04 
 
 		 309 aa  53.5  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  37.84 
 
 		 777 aa  53.5  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  31.37 
 
 		 338 aa  50.8  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2876  plasmid-related protein  35.19 
 
 		 401 aa  49.7  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0061217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  24.13 
 
 		 515 aa  49.7  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  25.95 
 
 		 542 aa  48.5  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  34.41 
 
 		 334 aa  48.5  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  40.54 
 
 		 321 aa  48.5  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  23.24 
 
 		 489 aa  48.1  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  23.28 
 
 		 457 aa  48.1  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  37.08 
 
 		 775 aa  47.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  19.57 
 
 		 505 aa  47  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  37.08 
 
 		 775 aa  47  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  36.47 
 
 		 355 aa  45.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>