34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2984 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  100 
 
 		 542 aa  1068    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  53.92 
 
 		 515 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  37.26 
 
 		 621 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  33.27 
 
 		 666 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  32.3 
 
 		 815 aa  206  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  35.29 
 
 		 616 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  35.02 
 
 		 718 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  31.71 
 
 		 782 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  26.47 
 
 		 502 aa  100  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  26.15 
 
 		 489 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.455218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  27.79 
 
 		 489 aa  97.1  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3404  hypothetical protein  24.31 
 
 		 496 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  26.05 
 
 		 505 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  25.61 
 
 		 470 aa  89.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  23.82 
 
 		 488 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  25.27 
 
 		 499 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0396  hypothetical protein  27.55 
 
 		 501 aa  79.7  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.123682  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  27.48 
 
 		 813 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  24.86 
 
 		 469 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0243  hypothetical protein  24.75 
 
 		 509 aa  73.2  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1359  hypothetical protein  24.17 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5027  hypothetical protein  27.79 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475457  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  24.37 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1780  hypothetical protein  23.9 
 
 		 477 aa  67  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0303159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4606  hypothetical protein  25.52 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180041 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  21.66 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  27.71 
 
 		 507 aa  63.5  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  27.34 
 
 		 457 aa  57  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2834  hypothetical protein  23.53 
 
 		 520 aa  55.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2504  hypothetical protein  27.37 
 
 		 447 aa  55.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0875481 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  24.69 
 
 		 866 aa  54.3  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  21.23 
 
 		 534 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  25.06 
 
 		 848 aa  48.9  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2058  hypothetical protein  32.84 
 
 		 257 aa  43.9  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000253256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>