More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0974 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  100 
 
 
621 aa  1238    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  41.55 
 
 
666 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  39.91 
 
 
616 aa  280  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  41.22 
 
 
718 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  37.45 
 
 
542 aa  241  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  30.74 
 
 
815 aa  237  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  34.7 
 
 
515 aa  219  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  33.77 
 
 
782 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3404  hypothetical protein  22.97 
 
 
496 aa  103  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  45.54 
 
 
844 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  45.54 
 
 
468 aa  102  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  46.49 
 
 
459 aa  101  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  45.54 
 
 
474 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  40.65 
 
 
480 aa  100  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  38.26 
 
 
460 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  42.86 
 
 
903 aa  100  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4942  replicative DNA helicase  45.54 
 
 
939 aa  98.6  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  42.4 
 
 
452 aa  97.4  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  44.64 
 
 
449 aa  97.1  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5363  replicative DNA helicase  45.54 
 
 
832 aa  97.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  36.63 
 
 
461 aa  96.3  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4735  replicative DNA helicase  45.54 
 
 
749 aa  96.3  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  46.43 
 
 
469 aa  96.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7043  replicative DNA helicase  43.75 
 
 
772 aa  96.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  43.09 
 
 
452 aa  95.5  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4838  replicative DNA helicase  44.25 
 
 
865 aa  94.7  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2895  DnaB domain protein helicase domain protein  40.91 
 
 
448 aa  94.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213935  normal  0.144332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  40.8 
 
 
452 aa  94.4  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  37.18 
 
 
451 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5063  replicative DNA helicase  43.75 
 
 
871 aa  91.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.946946  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  37.98 
 
 
461 aa  91.3  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  34.64 
 
 
462 aa  90.9  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  37.21 
 
 
460 aa  90.5  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  41.07 
 
 
457 aa  90.1  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  40.71 
 
 
454 aa  89.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  46.43 
 
 
464 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  29.8 
 
 
457 aa  89.7  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  41.96 
 
 
1118 aa  89  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  44.64 
 
 
448 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4657  DnaB domain-containing protein  37.01 
 
 
824 aa  89.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.186052  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  44.64 
 
 
464 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  32.68 
 
 
458 aa  89  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  43.75 
 
 
874 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  24.69 
 
 
470 aa  88.2  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5027  hypothetical protein  28.94 
 
 
375 aa  88.2  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475457  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5366  DnaB helicase-like protein  35.96 
 
 
782 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5455  DnaB domain-containing protein  35.96 
 
 
782 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.049604  normal  0.0110505 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  23.65 
 
 
502 aa  87.4  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  35.96 
 
 
460 aa  87.4  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0878  DnaB domain-containing protein  42.86 
 
 
879 aa  87  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6030  DnaB domain-containing protein  42.86 
 
 
863 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  39.47 
 
 
453 aa  86.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  40 
 
 
462 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  35.56 
 
 
453 aa  84  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  40.31 
 
 
459 aa  84  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  41.07 
 
 
509 aa  84  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  33.33 
 
 
441 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  34.03 
 
 
473 aa  81.3  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  24.44 
 
 
505 aa  81.3  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  26.51 
 
 
489 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  24.24 
 
 
469 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  32.85 
 
 
454 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  37.5 
 
 
440 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  26.49 
 
 
466 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  41.07 
 
 
455 aa  79.3  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  34.62 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  39.29 
 
 
481 aa  79.7  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  31.39 
 
 
453 aa  79.3  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  36.15 
 
 
454 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  36.04 
 
 
463 aa  78.6  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  32.81 
 
 
456 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0216  replicative DNA helicase  25.57 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  37.84 
 
 
481 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  36.84 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  32.43 
 
 
441 aa  77.4  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  37.5 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  33.08 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  33.08 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  33.08 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  33.08 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  33.08 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  31.62 
 
 
442 aa  77  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 
1381 aa  76.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  33.08 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  38.02 
 
 
461 aa  75.5  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  33.08 
 
 
449 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  33.08 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  33.08 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  34.38 
 
 
453 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  33.59 
 
 
456 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  34.82 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  34.07 
 
 
460 aa  75.1  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  37.61 
 
 
879 aa  74.7  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  35.71 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  37.19 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  32.74 
 
 
445 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  35.9 
 
 
444 aa  72.8  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  30.08 
 
 
446 aa  73.2  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  33.33 
 
 
509 aa  72  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  25.87 
 
 
489 aa  72  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>