More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0349 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  100 
 
 		 666 aa  1362    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  41.24 
 
 		 621 aa  409  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  35.71 
 
 		 616 aa  282  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  37.02 
 
 		 718 aa  242  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  33.15 
 
 		 542 aa  216  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  30.67 
 
 		 815 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  31.19 
 
 		 515 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  29.41 
 
 		 782 aa  156  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  42.34 
 
 		 454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  45.67 
 
 		 452 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4838  replicative DNA helicase  40.6 
 
 		 865 aa  109  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  40.3 
 
 		 451 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4942  replicative DNA helicase  40.15 
 
 		 939 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  41.22 
 
 		 480 aa  100  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  39.69 
 
 		 903 aa  100  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  39.85 
 
 		 452 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  23.69 
 
 		 469 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  40.46 
 
 		 469 aa  99.4  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  42.24 
 
 		 449 aa  98.6  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5063  replicative DNA helicase  38.64 
 
 		 871 aa  99  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.946946  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3404  hypothetical protein  23.83 
 
 		 496 aa  98.2  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  44.66 
 
 		 461 aa  97.4  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  40.6 
 
 		 459 aa  97.4  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  39.85 
 
 		 452 aa  96.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  41.54 
 
 		 474 aa  96.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7043  replicative DNA helicase  38.93 
 
 		 772 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  40 
 
 		 844 aa  96.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4735  replicative DNA helicase  41.18 
 
 		 749 aa  96.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  41.07 
 
 		 460 aa  97.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  40 
 
 		 468 aa  95.9  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  36.92 
 
 		 453 aa  96.3  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  37.4 
 
 		 1118 aa  95.9  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  37.8 
 
 		 457 aa  95.5  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  37.8 
 
 		 460 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  35.88 
 
 		 462 aa  94.4  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  28.62 
 
 		 441 aa  94.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5363  replicative DNA helicase  39.66 
 
 		 832 aa  93.6  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  38.35 
 
 		 444 aa  93.2  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  43.88 
 
 		 509 aa  92.8  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  36.15 
 
 		 457 aa  92.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  36.15 
 
 		 461 aa  92.8  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  23.22 
 
 		 502 aa  91.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  29.55 
 
 		 446 aa  91.3  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6030  DnaB domain-containing protein  37.4 
 
 		 863 aa  91.3  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  41.22 
 
 		 464 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  37.41 
 
 		 445 aa  91.3  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0878  DnaB domain-containing protein  37.4 
 
 		 879 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  28.01 
 
 		 455 aa  90.1  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  38.41 
 
 		 874 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  36.09 
 
 		 481 aa  90.5  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  33.33 
 
 		 447 aa  89.7  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5366  DnaB helicase-like protein  36.3 
 
 		 782 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  42.06 
 
 		 453 aa  89.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  37.78 
 
 		 464 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5455  DnaB domain-containing protein  36.3 
 
 		 782 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.049604  normal  0.0110505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  33.11 
 
 		 481 aa  89  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  36.62 
 
 		 453 aa  89  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  36.62 
 
 		 453 aa  89  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  36.62 
 
 		 453 aa  89  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  36.62 
 
 		 453 aa  89  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  36.3 
 
 		 460 aa  89  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  36.62 
 
 		 453 aa  89  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  36.62 
 
 		 453 aa  89  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  36.62 
 
 		 453 aa  89  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  36.62 
 
 		 449 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  37.78 
 
 		 448 aa  89  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  40.95 
 
 		 481 aa  88.6  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  36.62 
 
 		 453 aa  88.6  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2895  DnaB domain protein helicase domain protein  40.52 
 
 		 448 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213935  normal  0.144332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  34.97 
 
 		 456 aa  88.2  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  28.15 
 
 		 444 aa  88.2  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4657  DnaB domain-containing protein  35.71 
 
 		 824 aa  88.2  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.186052  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  31.11 
 
 		 451 aa  87.8  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  31.11 
 
 		 451 aa  87.8  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  33.77 
 
 		 440 aa  87.4  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  36.84 
 
 		 509 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  36.62 
 
 		 453 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1662  replicative DNA helicase  36.84 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000265874  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  36.03 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  37.88 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  25.56 
 
 		 534 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  33.78 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  33.33 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1232  replicative DNA helicase  30.72 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.323473  normal  0.298764 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  34.29 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  21.84 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  33.78 
 
 		 458 aa  83.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  36.92 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  32.62 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1242  replicative DNA helicase  33.08 
 
 		 528 aa  80.1  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  29.73 
 
 		 446 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  34.92 
 
 		 529 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  29.08 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  29.24 
 
 		 463 aa  79.7  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  37.82 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  31.94 
 
 		 879 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  33.82 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  37.69 
 
 		 454 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3492  DnaB domain protein helicase domain protein  31.85 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  27.05 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>