37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1924 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  100 
 
 
616 aa  1232    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  36.97 
 
 
666 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  41 
 
 
621 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  40.09 
 
 
718 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  32.6 
 
 
815 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  33.47 
 
 
515 aa  220  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  36.58 
 
 
542 aa  210  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  35.1 
 
 
782 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  26.45 
 
 
469 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  26.67 
 
 
470 aa  113  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3404  hypothetical protein  25.61 
 
 
496 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  26.98 
 
 
489 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  27.25 
 
 
489 aa  104  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  23.74 
 
 
502 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  24.79 
 
 
461 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5027  hypothetical protein  34.38 
 
 
375 aa  99  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475457  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  21.74 
 
 
499 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  22.44 
 
 
488 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0243  hypothetical protein  24.89 
 
 
509 aa  81.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  24.44 
 
 
505 aa  78.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  24.95 
 
 
866 aa  77  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  23.01 
 
 
534 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  25.25 
 
 
466 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1780  hypothetical protein  24.1 
 
 
477 aa  66.6  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0303159  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  25.34 
 
 
507 aa  63.9  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2504  hypothetical protein  24.56 
 
 
447 aa  61.2  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0875481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4606  hypothetical protein  22.82 
 
 
465 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0180041 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0396  hypothetical protein  22.63 
 
 
501 aa  60.1  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.123682  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  28.2 
 
 
813 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0871  hypothetical protein  22.49 
 
 
458 aa  56.6  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0242601 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  20.14 
 
 
458 aa  54.7  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2276  hypothetical protein  27.65 
 
 
521 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656399  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  25.82 
 
 
457 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03960  hypothetical protein  20.08 
 
 
422 aa  50.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.23056  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  23.54 
 
 
848 aa  49.7  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2834  hypothetical protein  25.08 
 
 
520 aa  48.9  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1359  hypothetical protein  24.53 
 
 
542 aa  46.2  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>