38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0963 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1037    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  57.08 
 
 		 542 aa  514  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  30.43 
 
 		 815 aa  231  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  33.47 
 
 		 616 aa  205  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  35.26 
 
 		 621 aa  202  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  30.47 
 
 		 666 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  34.3 
 
 		 718 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  30.37 
 
 		 782 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  27.17 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  28.3 
 
 		 489 aa  110  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.455218 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  25.55 
 
 		 502 aa  107  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  27.15 
 
 		 489 aa  104  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  23.85 
 
 		 470 aa  98.6  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  24.89 
 
 		 534 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0243  hypothetical protein  26.57 
 
 		 509 aa  97.4  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  27.23 
 
 		 466 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  22.88 
 
 		 469 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  25.83 
 
 		 505 aa  87.4  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0396  hypothetical protein  27.53 
 
 		 501 aa  82.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.123682  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  24.43 
 
 		 499 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4606  hypothetical protein  25.11 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3404  hypothetical protein  22.11 
 
 		 496 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1359  hypothetical protein  22.99 
 
 		 542 aa  75.5  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  24.09 
 
 		 813 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  26.63 
 
 		 507 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2504  hypothetical protein  29.38 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0875481 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  20.62 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1780  hypothetical protein  22.51 
 
 		 477 aa  66.6  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0303159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5027  hypothetical protein  26.44 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475457  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  25.41 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00297  hypothetical protein  23.01 
 
 		 701 aa  65.1  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2834  hypothetical protein  22.76 
 
 		 520 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2058  hypothetical protein  36.36 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000253256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  23.52 
 
 		 866 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  23.7 
 
 		 848 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3216  hypothetical protein  23.99 
 
 		 655 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000265804 
 
 
-
 
NC_002950  PG0871  hypothetical protein  20.3 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0242601 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  27.21 
 
 		 458 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>