28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1780 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1780  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  993    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0303159  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  34.65 
 
 		 469 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  33.55 
 
 		 470 aa  266  5.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  30.77 
 
 		 461 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  29.4 
 
 		 502 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  28.86 
 
 		 488 aa  200  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  28.85 
 
 		 489 aa  194  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.455218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  28.07 
 
 		 489 aa  194  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  29.06 
 
 		 505 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  29.06 
 
 		 499 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  30.09 
 
 		 534 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0396  hypothetical protein  25.11 
 
 		 501 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.123682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2276  hypothetical protein  23.03 
 
 		 521 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656399  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  24.95 
 
 		 466 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  24.39 
 
 		 457 aa  95.5  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4606  hypothetical protein  23.65 
 
 		 465 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180041 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  25.16 
 
 		 507 aa  87.8  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  22.09 
 
 		 666 aa  77.4  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  21.67 
 
 		 815 aa  71.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  23.9 
 
 		 542 aa  67.8  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  22.44 
 
 		 515 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  23.43 
 
 		 616 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  21.58 
 
 		 782 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3404  hypothetical protein  22.9 
 
 		 496 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0871  hypothetical protein  22.12 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0242601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  21.88 
 
 		 621 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  21.88 
 
 		 458 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  22.75 
 
 		 718 aa  47  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>