30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1442 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  1012    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  87.53 
 
 		 489 aa  885    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.455218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  57.62 
 
 		 488 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  43.1 
 
 		 499 aa  359  8e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  30.5 
 
 		 469 aa  217  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  31.25 
 
 		 505 aa  213  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  29.54 
 
 		 461 aa  206  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  30.33 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1780  hypothetical protein  28.07 
 
 		 477 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0303159  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  28.66 
 
 		 502 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  28.44 
 
 		 534 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0396  hypothetical protein  25.44 
 
 		 501 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.123682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  24.52 
 
 		 466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  26.46 
 
 		 507 aa  108  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  27.15 
 
 		 515 aa  101  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4606  hypothetical protein  24.83 
 
 		 465 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180041 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  27.95 
 
 		 542 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2276  hypothetical protein  24.67 
 
 		 521 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656399  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  26.46 
 
 		 616 aa  90.5  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  23.25 
 
 		 457 aa  87.8  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2504  hypothetical protein  23.87 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0875481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  24.93 
 
 		 718 aa  74.3  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  24.49 
 
 		 815 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  27.18 
 
 		 621 aa  71.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  24.44 
 
 		 782 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  21.53 
 
 		 666 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3404  hypothetical protein  22.02 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2058  hypothetical protein  22.48 
 
 		 257 aa  56.6  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000253256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  23.24 
 
 		 866 aa  48.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3216  hypothetical protein  23.13 
 
 		 655 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000265804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>