19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1624 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  956    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0871  hypothetical protein  34.93 
 
 
458 aa  248  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0242601 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03960  hypothetical protein  29.77 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.23056  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  29.37 
 
 
866 aa  151  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  26.17 
 
 
813 aa  92.8  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2603  hypothetical protein  24.34 
 
 
517 aa  89.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0243  hypothetical protein  24.05 
 
 
509 aa  85.1  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2834  hypothetical protein  24.3 
 
 
520 aa  84  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  23.56 
 
 
848 aa  75.1  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1359  hypothetical protein  23.51 
 
 
542 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  23.62 
 
 
815 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  23.04 
 
 
782 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  21.51 
 
 
621 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  22.06 
 
 
469 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  24.06 
 
 
461 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2276  hypothetical protein  19.26 
 
 
521 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656399  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  23.67 
 
 
505 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  21.58 
 
 
488 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  19.91 
 
 
616 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>