26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2301 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  910    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  34.87 
 
 
507 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  32.72 
 
 
466 aa  173  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4606  hypothetical protein  29.72 
 
 
465 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0180041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2504  hypothetical protein  27.7 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0875481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0396  hypothetical protein  27.57 
 
 
501 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.123682  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  27.07 
 
 
488 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  26.42 
 
 
502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  25.23 
 
 
470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  25.73 
 
 
469 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  25.32 
 
 
461 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2058  hypothetical protein  32.05 
 
 
257 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000253256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  25.56 
 
 
505 aa  100  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  23.25 
 
 
489 aa  89.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1780  hypothetical protein  24.39 
 
 
477 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0303159  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  23.43 
 
 
489 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  23.65 
 
 
815 aa  70.5  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  22.15 
 
 
499 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  25.31 
 
 
515 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  21.43 
 
 
534 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  23.38 
 
 
666 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  26.85 
 
 
542 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2276  hypothetical protein  25.59 
 
 
521 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656399  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  25.84 
 
 
621 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  25.29 
 
 
782 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  23.28 
 
 
866 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>