28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1690 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  100 
 
 
499 aa  1035    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  44.35 
 
 
488 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  43.1 
 
 
489 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  42.32 
 
 
489 aa  365  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455218 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  30.95 
 
 
470 aa  206  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  31.14 
 
 
469 aa  203  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  30.63 
 
 
505 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1780  hypothetical protein  29.72 
 
 
477 aa  180  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0303159  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  28.95 
 
 
461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  27.3 
 
 
502 aa  144  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  25.49 
 
 
534 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  24.31 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4606  hypothetical protein  26.12 
 
 
465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0180041 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  25.17 
 
 
507 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0396  hypothetical protein  23.79 
 
 
501 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.123682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2276  hypothetical protein  25.46 
 
 
521 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656399  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  20.95 
 
 
616 aa  90.9  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2504  hypothetical protein  24.82 
 
 
447 aa  86.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0875481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  24.73 
 
 
542 aa  79  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  22.7 
 
 
782 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  23.12 
 
 
515 aa  77.4  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  24.79 
 
 
815 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3404  hypothetical protein  23.1 
 
 
496 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  22.15 
 
 
457 aa  71.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  21.51 
 
 
666 aa  64.7  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  21.58 
 
 
718 aa  61.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2058  hypothetical protein  26.67 
 
 
257 aa  53.5  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000253256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  22.38 
 
 
621 aa  50.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>