29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1302 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  961    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  40.51 
 
 
470 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  40.22 
 
 
469 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  31.12 
 
 
488 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1780  hypothetical protein  30.77 
 
 
477 aa  211  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0303159  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  30.9 
 
 
489 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  29.54 
 
 
489 aa  206  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  29.05 
 
 
502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  27.8 
 
 
505 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  28.92 
 
 
499 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  25.22 
 
 
534 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0396  hypothetical protein  25.51 
 
 
501 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.123682  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  26.52 
 
 
507 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2276  hypothetical protein  25.59 
 
 
521 aa  114  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656399  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  25.32 
 
 
457 aa  99.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  25.41 
 
 
466 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4606  hypothetical protein  27.05 
 
 
465 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0180041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  25.35 
 
 
616 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  25.14 
 
 
815 aa  86.7  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  23.03 
 
 
782 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  23.01 
 
 
666 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  24.26 
 
 
866 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  21.12 
 
 
542 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  20 
 
 
515 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2504  hypothetical protein  25.35 
 
 
447 aa  58.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0875481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  25.64 
 
 
621 aa  56.6  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  23.37 
 
 
718 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  24.06 
 
 
458 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2058  hypothetical protein  23.68 
 
 
257 aa  50.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000253256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>