111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0087 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  100 
 
 		 782 aa  1571    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  30.66 
 
 		 813 aa  203  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  35.1 
 
 		 616 aa  192  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  43.71 
 
 		 848 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  42 
 
 		 746 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  40.3 
 
 		 275 aa  163  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  37.96 
 
 		 272 aa  159  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  34.27 
 
 		 621 aa  157  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  36.48 
 
 		 1255 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  39.76 
 
 		 718 aa  153  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  30.37 
 
 		 515 aa  153  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  29.41 
 
 		 666 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  39.05 
 
 		 278 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  35.96 
 
 		 778 aa  151  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  35.4 
 
 		 277 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  29.13 
 
 		 815 aa  144  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  32.85 
 
 		 542 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  39.19 
 
 		 271 aa  140  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  34.29 
 
 		 1557 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  34.84 
 
 		 1389 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  34.88 
 
 		 818 aa  124  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  35 
 
 		 326 aa  121  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  35.03 
 
 		 739 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1504  hypothetical protein  39.29 
 
 		 326 aa  120  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  41.54 
 
 		 797 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  42.72 
 
 		 950 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  35.42 
 
 		 744 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  33.9 
 
 		 338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0017  cpp22  26.99 
 
 		 408 aa  114  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113965  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  33.1 
 
 		 1448 aa  112  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  32.74 
 
 		 1448 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  33.9 
 
 		 297 aa  110  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a039  DNA primase TraC  28.57 
 
 		 357 aa  110  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000018393  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  45.13 
 
 		 955 aa  109  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  43.28 
 
 		 958 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  43.28 
 
 		 958 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a034  DNA primase TraC  28.57 
 
 		 411 aa  108  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000906567  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  32.57 
 
 		 1580 aa  107  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  43.59 
 
 		 953 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  43.78 
 
 		 953 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  43.69 
 
 		 955 aa  105  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  37.02 
 
 		 368 aa  105  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  32.01 
 
 		 303 aa  105  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  44.17 
 
 		 950 aa  105  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  38.89 
 
 		 736 aa  104  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6195  hypothetical protein  34.43 
 
 		 523 aa  104  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374342  normal  0.646771 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  25.56 
 
 		 502 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  38.92 
 
 		 621 aa  102  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  38.92 
 
 		 354 aa  101  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  32.34 
 
 		 986 aa  97.4  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  33.33 
 
 		 357 aa  95.9  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0611  Cpp22  28.41 
 
 		 430 aa  95.1  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1495 aa  94  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  33.08 
 
 		 833 aa  93.6  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  35.96 
 
 		 890 aa  91.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0173  Primase 2  31.08 
 
 		 637 aa  91.3  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.214274 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  35.44 
 
 		 899 aa  89.7  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  36.06 
 
 		 878 aa  89.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  34.48 
 
 		 890 aa  88.6  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  26.47 
 
 		 505 aa  88.2  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  25.68 
 
 		 488 aa  87.8  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  33.7 
 
 		 775 aa  86.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  33.68 
 
 		 775 aa  86.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  24.38 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  34.8 
 
 		 777 aa  84.7  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0459  putative DNA replication primase  32.86 
 
 		 644 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  33.17 
 
 		 895 aa  83.2  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  37.95 
 
 		 763 aa  82.4  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  37.95 
 
 		 763 aa  82.4  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  35.67 
 
 		 681 aa  81.6  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  33.79 
 
 		 777 aa  81.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  37.95 
 
 		 273 aa  80.5  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  35.68 
 
 		 777 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  35.68 
 
 		 777 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  35.67 
 
 		 681 aa  80.5  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  35.67 
 
 		 678 aa  80.1  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2504  hypothetical protein  28.33 
 
 		 447 aa  79.7  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0875481 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  35.68 
 
 		 777 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  23.06 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  29.5 
 
 		 776 aa  74.7  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5027  hypothetical protein  30.22 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475457  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  34.46 
 
 		 1077 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.18 
 
 		 866 aa  74.3  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  30.08 
 
 		 896 aa  74.3  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1359  hypothetical protein  23.53 
 
 		 542 aa  73.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  33.93 
 
 		 835 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3404  hypothetical protein  23.82 
 
 		 496 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  22.01 
 
 		 499 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  23.03 
 
 		 461 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0243  hypothetical protein  25.1 
 
 		 509 aa  72  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  29.77 
 
 		 777 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6494  Primase 2  30.88 
 
 		 621 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.921039 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  33.33 
 
 		 615 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  24.44 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  26.53 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4842  hypothetical protein  33.71 
 
 		 615 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  33.71 
 
 		 615 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  23.04 
 
 		 458 aa  67  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1765  putative DNA replication primase  28.93 
 
 		 621 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121744  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  22.61 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.455218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>