18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3404 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3404  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  1035    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  25.79 
 
 		 718 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  25.61 
 
 		 616 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  24.56 
 
 		 621 aa  93.6  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  25.98 
 
 		 815 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  23.12 
 
 		 666 aa  90.1  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  23.96 
 
 		 542 aa  88.2  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  22.11 
 
 		 515 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  23.82 
 
 		 782 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  23.1 
 
 		 499 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  22.02 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  21.27 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  21.04 
 
 		 502 aa  55.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  24.4 
 
 		 534 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  20.73 
 
 		 489 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.455218 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  20.76 
 
 		 470 aa  51.2  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1780  hypothetical protein  23.26 
 
 		 477 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0303159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  22.63 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>