29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4690 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  100 
 
 
534 aa  1118    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  30.59 
 
 
469 aa  192  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  28.15 
 
 
470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1780  hypothetical protein  30.09 
 
 
477 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0303159  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  28.57 
 
 
489 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  28.44 
 
 
489 aa  150  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  25.22 
 
 
461 aa  147  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  26.03 
 
 
505 aa  143  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  26.93 
 
 
488 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  25.22 
 
 
502 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0396  hypothetical protein  26.87 
 
 
501 aa  123  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.123682  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  26.27 
 
 
499 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2276  hypothetical protein  23.11 
 
 
521 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656399  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  25.22 
 
 
515 aa  94.4  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  24.16 
 
 
466 aa  94  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4606  hypothetical protein  22.56 
 
 
465 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0180041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  25.56 
 
 
666 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  23.87 
 
 
507 aa  80.9  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2058  hypothetical protein  27.39 
 
 
257 aa  62  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000253256 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2504  hypothetical protein  23.93 
 
 
447 aa  60.8  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0875481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  22.87 
 
 
616 aa  60.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  22.69 
 
 
815 aa  57  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  21.43 
 
 
457 aa  53.9  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  24.41 
 
 
621 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3404  hypothetical protein  24.4 
 
 
496 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  23.06 
 
 
718 aa  48.9  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  23.1 
 
 
782 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  20.96 
 
 
542 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0871  hypothetical protein  19.32 
 
 
458 aa  45.4  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0242601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>