25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2504 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2504  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  924    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0875481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  31.05 
 
 		 507 aa  167  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  27.7 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  28.19 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0396  hypothetical protein  30.24 
 
 		 501 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.123682  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4606  hypothetical protein  31.87 
 
 		 465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180041 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  26.15 
 
 		 469 aa  107  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  24.57 
 
 		 502 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2058  hypothetical protein  30.87 
 
 		 257 aa  98.2  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000253256 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  24.41 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  23.74 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  24.88 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  23.87 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  28.33 
 
 		 782 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  23.89 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  23.8 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.455218 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  29.38 
 
 		 515 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  23.93 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2276  hypothetical protein  25 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656399  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  24.77 
 
 		 616 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  25.35 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  22.35 
 
 		 815 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  25.44 
 
 		 718 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  29.45 
 
 		 542 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  22.46 
 
 		 666 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>