18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2058 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2058  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000253256 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  51.82 
 
 		 507 aa  236  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  32.05 
 
 		 457 aa  102  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2504  hypothetical protein  30.87 
 
 		 447 aa  98.2  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0875481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  33.49 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  28.16 
 
 		 469 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  26.58 
 
 		 470 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0396  hypothetical protein  28.7 
 
 		 501 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.123682  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4606  hypothetical protein  27.57 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180041 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  24.53 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.455218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  24.2 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  27.39 
 
 		 534 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  36.36 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  22.48 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  26.67 
 
 		 499 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  23.68 
 
 		 461 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  27.21 
 
 		 815 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  25.15 
 
 		 502 aa  45.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>