29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0744 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  940    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4606  hypothetical protein  58.72 
 
 		 465 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180041 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0396  hypothetical protein  32.24 
 
 		 501 aa  220  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.123682  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  33.67 
 
 		 507 aa  212  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  31.76 
 
 		 502 aa  176  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  32.72 
 
 		 457 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 		 469 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  26.43 
 
 		 470 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2504  hypothetical protein  28.19 
 
 		 447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0875481 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  26.77 
 
 		 488 aa  131  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  23.87 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  24.52 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  24.83 
 
 		 489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.455218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  24.26 
 
 		 505 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  26.33 
 
 		 815 aa  100  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  27.23 
 
 		 515 aa  94.4  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  24.16 
 
 		 534 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  25.41 
 
 		 461 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1780  hypothetical protein  24.95 
 
 		 477 aa  93.2  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0303159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2058  hypothetical protein  33.49 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000253256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  25.6 
 
 		 621 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  23.68 
 
 		 542 aa  66.6  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  27.44 
 
 		 616 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  22 
 
 		 666 aa  63.9  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.7 
 
 		 866 aa  57  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  25.94 
 
 		 782 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  24.9 
 
 		 718 aa  56.6  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2276  hypothetical protein  24.7 
 
 		 521 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656399  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3404  hypothetical protein  23.51 
 
 		 496 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>