33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1050 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  71.77 
 
 		 470 aa  697    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  975    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  40.22 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  33.62 
 
 		 502 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1780  hypothetical protein  34.65 
 
 		 477 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0303159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  32.41 
 
 		 505 aa  236  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  31.33 
 
 		 488 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  31.15 
 
 		 489 aa  219  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.455218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  30.5 
 
 		 489 aa  217  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  31.14 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  30.59 
 
 		 534 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0396  hypothetical protein  27.1 
 
 		 501 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.123682  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  26.92 
 
 		 507 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2276  hypothetical protein  24.84 
 
 		 521 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656399  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  27.14 
 
 		 466 aa  137  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4606  hypothetical protein  25.24 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  25 
 
 		 616 aa  107  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2504  hypothetical protein  26.15 
 
 		 447 aa  107  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0875481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  25.73 
 
 		 457 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  23.46 
 
 		 666 aa  97.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  23.03 
 
 		 515 aa  90.1  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  23.66 
 
 		 815 aa  80.1  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  26.05 
 
 		 718 aa  78.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  23.06 
 
 		 782 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2058  hypothetical protein  28.16 
 
 		 257 aa  72.4  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000253256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  25.07 
 
 		 621 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  23.96 
 
 		 542 aa  70.5  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  22.98 
 
 		 866 aa  64.7  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  22.06 
 
 		 458 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0871  hypothetical protein  21.66 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0242601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  24.05 
 
 		 813 aa  44.3  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03960  hypothetical protein  21.51 
 
 		 422 aa  43.5  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.23056  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0243  hypothetical protein  19.04 
 
 		 509 aa  43.1  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>